Heteroduplex tracking assay (hta) for genotyping hcv

Details Heteroduplex tracking assay (hta) for genotyping hcv Heteroduplex tracking assay (hta) for genotyping hcv

C - Chemistry, Metallurgy

07

H

C07H 21/04 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01)

Patent

CA 2251673

A heteroduplex tracking assay (HTA), a hybridization based method of determining the genetic relationship between two or more viral genomes, for genotyping HCV is disclosed. The HTA for genotyping HCV was developed using single stranded probes derived from the carboxyl terminus of core and part of the E1 for HCV subtypes (1a, 1b, 2a, 2b, and 3a). HTA is more accurate than RFLP for sub-typing HCV and has potential for identifying new variants and is useful for epidemiological studies.

L'invention a trait à une épreuve de recherche des hétéroduplex (HTA) ainsi qu'à une méthode fondée sur l'hybridation permettant de déterminer les relations géniques existant entre deux génomes viraux ou davantage et ce, afin d'établir le génotype du virus de l'hépatite C (VHC). C'est en utilisant des sondes à un seul brin, dérivées de l'extrémité C-terminale d'un noyau ainsi que d'une partie de la région de la glycoprotéine E1 pour des sous-types du VHC, 1a, 1b, 2a, 2b et 3a, qu'a été mise au point cette épreuve de recherche (HTA) permettant d'établir le génotype du VHC.

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