High density immobilization of nucleic acids

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H

Patent

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C07H 21/00 (2006.01) B01J 19/00 (2006.01) B01L 3/02 (2006.01) C07B 61/00 (2006.01) C07F 9/24 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C40B 40/06 (2006.01) C40B 50/14 (2006.01) C40B 60/14 (2006.01) G01N 35/10 (2006.01) G01N 35/00 (2006.01)

Patent

CA 2268740

Processes and kits for immobilizing a high density of nucleic acids on an insoluble surface, which are particularly useful for mass spectrometric detection of nucleic acids, are disclosed. Arrays containing the immobilized nucleic acids and use of the immobilized nucleic acids in a variety of solid phase nucleic acid chemistry applications, including nucleic acid synthesis (chemical and enzymatic), hybridization and/or extension, and sequencing, are provided. Serial and parallel dispensing tools that can deliver defined volumes of fluid to generate multi-element arrays of sample material on a substrate surface are further provided. Tools provided herein can include an assembly of vesicle elements, or pins, wherein each of the pins can include a narrow interior chamber suitable for holding nanoliter volumes of fluid. Methods for dispensing tools that can be employed to generate multi-element arrays of sample material on a substrate surface are also provided. The tool can dispense a spot of fluid to a substrate surface by spraying the fluid from the pin, contacting the substrate surface or forming a drop that touches against the substrate surface. The tool can form an array of sample material by dispensing sample material in a series of steps, while moving the pin to different locations above the substrate surface to form the sample array. The prepared sample arrays may be passed to a plate assembly that disposes the sample arrays for analysis by mass spectrometry.

L'invention concerne des procédés et des nécessaires pour l'immobilisation d'une densité élevée d'acides nucléiques sur une surface insoluble, et particulièrement utiles pour la détection d'acides nucléiques par spectrométrie de masse. Les groupements contenant les acides nucléiques immobilisés et l'utilisation des acides nucléiques immobilisés dans une grande variété d'application chimiques relatives aux acides nucléiques en phase solide, dont la synthèse (chimique et enzymatique) l'hybridation et/ou l'extension d'acide nucléique et la détermination de séquences nucléotidiques. Des outils de distribution en parallèle ou en série pouvant distribuer des volumes définis de fluide pour la génération de groupements d'éléments multiples d'un matériau échantillon sur un substrat sont également décrits. Lesdits outils peuvent comprendre un ensemble de vésicules ou de tiges, ces dernières pouvant contenir une chambre intérieure étroite pouvant contenir des volumes de fluide de l'ordre du nanolitre. Des procédés relatifs aux outils de distribution, qui peuvent être utilisés pour la génération de groupements d'éléments multiples d'un matériau échantillon sur un substrat, sont également décrits. L'outil peut distribuer une goutte de fluide à un substrat en pulvérisant du liquide depuis la tige, en touchant le substrat ou en formant une goutte qui vient en contact avec le substrat. L'outil peut permettre de former un groupement d'un matériau échantillon en distribuant le matériau échantillon dans une série d'étapes, tout en déplaçant la tige vers différents emplacements au-dessus du substrat pour former le groupement d'échantillon. Les groupements d'échantillons préparés peuvent être envoyés à un ensemble plaque qui les dispose pour qu'ils puissent être analysés par spectométrie de masse.

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