C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2315776
The present invention relates to compositions, apparatus and methods useful for concurrently performing multiple, high throughput, biological or chemical assays, using repeated arrays of probes. A combination of the invention comprises a surface, which comprises a plurality of test regions, at least two of which, and in a preferred embodiment, at least twenty of which, are substantially identical, wherein each of the test regions comprises an array of generic anchor molecules. The anchors are associated with bifunctional linker molecules, each containing a portion which is specific for at least one of the anchors and a portion which is a probe specific for a target of interest. The resulting array of probes is used to analyze the presence or test the activity of one or more target molecules which specifically interact with the probes. In one embodiment of the invention, the test regions (which can be wells) are further subdivided into smaller subregions (indentations, or dimples). In one embodiment of the invention, ESTs are mapped. In another embodiment, the presence of a target nucleic acid is detected by protecting the target against nuclease digestion with a polynucleotide fragment, and analyzing the protected polynucleotide by mass spectrometry.
La présente invention porte sur des compositions, un appareil et des procédés utilisés simultanément pour effectuer plusieurs dosages biologiques ou chimiques à haut rendement, à l'aide de matrices de sondes. Une combinaison de l'invention comprend une surface constituée de plusieurs régions de test, dont au moins deux, et selon une réalisation préférée, dont au moins vingt, sont pratiquement identiques, chacune de ces régions test comprenant une matrice de molécules d'ancrage génériques. Les éléments d'ancrage sont associés à des molécules de liaison bifonctionnelles, chacune contenant une partie spécifique à au moins un des éléments d'ancrage, et une partie qui est une sonde spécifique d'une cible. La matrice de sondes obtenue est utilisée pour analyser ou tester l'activité d'une ou plusieurs molécules cibles qui ont une interaction spécifique avec les sondes. Selon une réalisation préférée, les régions de test (qui peuvent être des puits) sont également subdivisées en sous-régions plus petites (creux ou dépressions). Selon une réalisation de cette invention, les EST sont cartographiés. Selon une autre réalisation, on détecte la présence d'un acide nucléique cible en protégeant la cible de la digestion de la nucléase avec un fragment polynucléotidique, et en analysant le polynucléotide protégé par spectrométrie de masse.
Felder Stephen
Kris Richard M.
Felder Stephen
Johnson Ernest Peter
Kris Richard M.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1699933