High throughput method and kit

Details High throughput method and kit High throughput method and kit

G - Physics

01

N

G01N 33/68 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) G01N 33/543 (2006.01) G01N 33/58 (2006.01)

Patent

CA 2419908

A parallel high throughput method and kit for the discovery of small molecule interactors of target proteins, in particular, target proteins expressed from entire genomes or subsets thereof. The target module is prepared by binding selectively a target protein, modified to allow its detection, to a surrogate ligand that is linked to an individually detectable bead. Sets of target modules are mixed together in each chamber of a multi-chamber container. A test compound or collection of test compounds is added to each chamber, and the interaction of a compound with each target module is observed. A compound that is specific for a particular target protein will displace that protein from its target module. The identity of the target module so disrupted is determined by identifying the particular bead to which the displaced target protein was attached.

L'invention concerne un procédé et un kit à haut rendement en temps réel pour la découverte de petites molécules capables d'interagir avec des protéines cibles, en particulier des protéines cibles exprimées par des génomes entiers ou sous-ensembles desdits génomes. On prépare le module cible en liant sélectivement une protéine cible, modifiée afin de permettre sa détection, à un liant de substitution relié à une bille pouvant être détectée individuellement. Des ensembles de modules cibles sont mélangés dans chaque chambre d'un conteneur à plusieurs chambres. Un composé test ou un éventail de composés tests est ajouté à chaque chambre et l'interaction d'un composé avec chaque module cible est observée. Un composé spécifique à une protéine cible particulière va déplacer cette protéine par rapport à son module cible. On détermine l'identité du module cible, ainsi perturbé, en identifiant la bille particulière à laquelle cette protéine cible déplacée était reliée.

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