High throughput nucleic acid sequencing by expansion

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/02 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01)

Patent

CA 2691364

Nucleic acid sequencing methods and related products are disclosed. Methods for sequencing a target nucleic acid comprise providing a daughter strand produced by a template-directed synthesis, the daughter strand comprising a plurality of sub-units coupled in a sequence corresponding to a contiguous nucleotide sequence of all or a portion of the target nucleic acid, wherein the individual subunits comprise a tether, at least one probe or nucleobase residue, and at least one selectively cleavable bond. The selectively cleavable bond(s) is/are cleaved to yield an Xpandomer of a length longer than the plurality of the subunits of the daughter strand, the Xpandomer comprising the tethers and reporter elements for parsing genetic information in a sequence corresponding to the contiguous nucleotide sequence of all or a portion of the target nucleic acid. Reporter elements of the Xpandomer are then detected. Corresponding products, including Xpandomers and oligomeric and monomeric substrate constructs are also disclosed.

La présente invention concerne des procédés et des produits apparentés. Les procédés de séquençage d'un acide nucléique cible consistent à obtenir une molécule fille à la suite d'une synthèse contrôlée par matrice, la molécule fille étant composée d'une pluralité de sous-unités associées en une séquence correspondant à une séquence contiguë de nucléotides de l'ensemble ou d'une partie de l'acide nucléique cible, les sous-unités individuelles comprenant une attache, au moins une sonde ou un résidu de nucléobase et au moins un lien pouvant se cliver de manière sélective. Le ou les liens susceptibles de se cliver de manière sélective sont clivés afin d'obtenir un Xpandomère dont la longueur dépasse celle de la pluralité de sous-unités de la molécule fille, le Xpandomère comprenant les attaches et les éléments reporter afin d'analyser les informations génétiques présentes dans une séquence correspondant à la séquence de nucléotides contiguë de l'ensemble ou d'une partie de l'acide nucléique cible. Les éléments reporter du Xpandomère sont ensuite détectés. L'invention porte également sur des produits apparentés comprenant des constructions de substrats Xpandomères, oligomères et monomères.

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