Hormone receptor functional entities and methods of their use

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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Details

C12N 15/62 (2006.01) C07K 14/72 (2006.01) C07K 19/00 (2006.01) C12N 5/06 (2006.01) C12N 5/08 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01)

Patent

CA 2388524

The invention provides chimeric proteins having at least two functional protein units, each containing the dimerization domain of a member of the steroid/thyroid hormone nuclear receptor superfamily. The chimeric proteins can fold under crystallization conditions to form functional entities. The functional entities optionally contain a novel flexible peptide linker of variable lengths between at least two of the protein units. In a preferred embodiment, the linker is designed to be increased in increments of 12 amino acids each to aid in preparation of variant chimeric proteins. The DNA binding characteristics of the invention functional entities differ from those of wild- type complexes formed between "monomeric" receptors and their binding partners. Some functional entities, e.g. dimers expressed as fusion proteins, transactivate responsive promoters in a manner similar to wild-type complexes, while others do not promote transactivation and function instead essentially as constitutive repressors. The invention further provides nucleotide sequences encoding the invention chimeric proteins, cells containing such nucleotide sequences, and methods for using the invention chimeric proteins to modulate expression of one or more exogenous genes in a subject organism. In addition, isolated protein crystals suitable for x-ray diffraction analysis and methods for obtaining putative ligands for the invention chimeric proteins are provided.

L'invention concerne des protéines chimériques ayant au moins deux unités de protéines fonctionnelles, chacune renfermant un domaine de dimérisation d'un élément de la superfamille du récepteur nucléaire de l'hormone stéroïde/thyroïde. Les protéines chimériques peuvent se plier dans des conditions de cristallisation afin de former des entités fonctionnelles. Les entités fonctionnelles contiennent éventuellement un nouveau lieur peptidique de longueur variable entre au moins deux des unités de protéines. Dans un mode de réalisation, le lieur est conçu pour être augmenté de 12 acides aminés à la fois afin d'aider à la préparation de protéines chimériques variantes. Les caractéristiques de liaison à l'ADN des entités fonctionnelles diffèrent de celles de complexes de type sauvage formés entre des récepteurs <= monomères >= et leurs partenaires de liaison. Certaines entités fonctionnelles, par exemples des dimères exprimés comme protéines hybrides, transactivent des promoteurs réactifs d'une manière semblable aux complexes de type sauvage, tandis que d'autres ne favorisent pas la transactivation et fonctionnent essentiellement comme des répresseurs constitutifs. L'invention concerne en outre des séquences nucléotidiques codant pour les protéines chimériques de la présente invention, des cellules contenant des séquences nucléotidiques, et des procédés d'utilisation des protéines chimériques pour moduler l'expression d'un ou de plusieurs gènes exogènes dans un organisme. L'invention concerne par ailleurs, des cristaux de protéines isolés adaptés pour une analyse de diffraction par rayon X et des procédés permettant d'obtenir des ligands putatifs destinés aux protéines chimériques de la présente invention.

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