Human papilloma virus detection in a nucleic acid...

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H

Patent

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Details

C07H 21/04 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01) G01N 33/48 (2006.01)

Patent

CA 2183758

Disclosed herein are oligonucleotides having sequences ID NO: 1-25, the oligonucleotides complementary to any one of these sequences and those differing by from 1 to 5 nucleotide substitutions occurring between different HPV strains with the exclusion of substitutions of the last two nucleotides at the 3' end. The oligonucleotides or fragments thereof being useful as primers in a nucleic acid amplification process, e.g. general primers PCR or NASBA, or LCR, to amplify DNA of genital HPV genotypes, e.g. in a method of analyzing a sample for the presence therein of HPV.

Les oligomères suivants: (i) le 23-mère 5'-TTTGTTACTGTGGTAGATACTAC-3' ou le 23-mère qui lui est complémentaire; (ii) un 23-mère dérivé de (i) par 1 à 5 substitutions nucléotidiques; (iii) un 23<+>-mère comportant une séquence 3' terminale constituée de (i) ou (ii); (iv) un fragment de (i) ou (ii) ayant une longueur allant de 8 à 18 nucléotides; (v) le 25-mère 5'-GAAAAATAAACTGTAAATCATATTC-3' ou le 25-mère qui lui est complémentaire; (vi) un 25-mère dérivé de (v) par 1 à 5 substitutions nucléotidiques; (vii) un 25<+>-mère comportant une séquence 3' terminale constituée de (v) ou (vi); (viii) le 28-mère 5'-GAAAAATAAACTGTAAATCATATTCTTC-3' ou le 28-mère qui lui est complémentaire; (ix) le 28-mère 5'-GAAAAATAAACTGTAAATCATATTCCTC-3' ou le 28-mère qui lui est complémentaire; (x) un 28-mère dérivé de (viii) ou (ix) par 1 à 5 substitutions nucléotidiques; (xi) un 28<+>-mère comportant une séquence 3' terminale constituée de (viii), (ix) ou (x); (xii) un fragment de (v), (vi), (viii), (ix) ou (x) ayant une longueur allant de 8 à 18 nucléotides; sont utilisables comme amorce dans un procédé d'amplification d'acide nucléique, par exemple un procédé de type PCR, NASBA<TM> (amplification de séquences génomiques) ou LCR à amorce générale, dans le but d'amplifier l'ADN des génotypes de VPH génital, par exemple dans un procédé de dépistage dans un échantillon de la présence du VPH.

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