Human papillomavirus e2 transactivation domain/inhibitor...

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – K

Patent

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Details

C07K 14/025 (2006.01) C07D 405/12 (2006.01) C07D 417/12 (2006.01) C12N 15/09 (2006.01) C12P 21/00 (2006.01) G01N 23/20 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01) G06F 17/50 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)

Patent

CA 2448482

A crystallizable composition, comprising an PV E2 TAD-like polypeptide of SEQ ID NO.2 complexed with an inhibitor L. The invention also provides a method for producing the crystallized HPV E2 TAD-inhibitor complex (HPV E2 TAD-L) comprising: a) mixing purified HPV E2 TAD, contained in a purification buffer, with solublized inhibitor L to generate a complex solution containing the HPV E2 TAD-L complex; and b) crystallizing the complex from a) in a crystallization buffer. The invention also provides a method for producing crystallized apo HPV E2 TAD, comprising: a) mixing apo HPV E2 TAD, contained in a purification buffer, with a crystallization buffer. X-ray crystal structure coordinates the HPV E2 TAD-L complex, are also provided, which define an inhibitor binding pocket. The inhibitor binding pocket is useful for screening potential small molecule inhibitors that bind to the pocket.

L'invention concerne une composition cristallisable, renfermant un polypeptide de PV E2 TAD numéroté SEQ ID NO.2 et associé en complexe à un inhibiteur L, et un procédé d'élaboration de ce complexe (HPV E2 TAD-L), selon les étapes suivantes: a) mélange de HPV E2 TAD purifié, contenant un tampon de purification, avec l'inhibiteur solubilisé L, pour donner une solution complexe renfermant le complexe HPV E2 TAD-L; et b) cristallisation du complexe issu de l'étape a) dans un tampon de cristallisation. L'invention concerne également un procédé relatif à l'élaboration d'un apo HPV E2 TAD cristallisé, selon les étapes suivantes: a) mélange de l'apo HPV E2 TAD, contenu dans le tampon de purification, avec un tampon de cristallisation. L'invention concerne également des coordonnées de radiographie de structure cristalline pour le complexe HPV E2 TAD-L, définissant une poche de liaison avec l'inhibiteur. Cette poche est utile pour le criblage d'inhibiteurs potentiels de molécules de petite taille qui se lient à la poche.

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