Identification and use of prognostic and predictive markers...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) A61K 39/395 (2006.01) A61K 39/40 (2006.01)

Patent

CA 2591716

The present invention provides a method of screening for markers useful in predicting the efficacy of a specified cancer that includes: (a) constructing a tissue microarray from a tissue bank comprising multiple tissue samples that are annotated with clinical follow up data; (b) labeling polynucleic acid probes specific for oncogenes or cancer associated genes known to be potential amplicons; (c) performing fluorescent in situ hybridization analysis on the tissue microarray; and (d) correlating the result of the fluorescent in situ hybridization with the clinical follow up data. In addition, the present invention provides a method of treating breast cancer that includes measuring the expression levels or amplification of HTPAP in a patient having breast cancer and then providing a patient having increased levels of HTPAP expression or HTPAP amplification with therapeutic quantities of at least one compound that interferes with the phosphatidic acid phosphatase activity of HTPAP. The present invention also encompasses a method of treating breast cancer that includes screening a breast cancer patient for amplification of the cMYC gene and then treating a patient having amplification of the cMYC gene with therapeutic quantities of a compound that interferes with HER2 signaling.

La présente invention concerne une méthode de criblage de marqueurs utiles pour prédire l'efficacité d'un cancer spécifié. Ladite méthode consiste : (a) à construire un microréseau tissulaire à partir d'une banque de tissus comprenant de multiples échantillons de tissus qui sont annotés à l'aide de données de suivi clinique ; (b) à marquer des sondes d'acide polynucléique spécifiques d'oncogènes ou de gènes associés au cancer connus pour être des amplicons potentiels ; (c) à effectuer une analyse par hybridation in situ fluorescente sur le microréseau tissulaire ; et (d) à corréler le résultat de l'hybridation in situ fluorescente avec les données de suivi clinique. De plus, la présente invention concerne une méthode de traitement du cancer du sein qui consiste à mesurer les niveaux d'expression ou l'amplification de HTPAP chez un patient présentant un cancer du sein puis à administrer à un patient présentant des niveaux accrus d'expression de HTPAP ou d'amplification de HTPAP des quantités thérapeutiques d'au moins un composé qui interfère avec l'activité de phosphatase acide phosphatidique de HTPAP. La présente invention concerne également une méthode de traitement du cancer du sein qui consiste à dépister une amplification du gène cMYC chez un patient atteint du cancer du sein puis à traiter un patient présentant une amplification du gène cMYC à l'aide de quantités thérapeutiques d'un composé qui interfère avec la signalisation par HER2.

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