Identification of a candidate resistance gene to blackleg...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

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C12N 15/82 (2006.01) A01H 1/00 (2006.01) A01H 1/04 (2006.01) A01H 3/00 (2006.01) A01H 5/00 (2006.01) C12N 9/12 (2006.01) C12N 15/29 (2006.01) C12N 15/54 (2006.01)

Patent

CA 2678955

Blackleg is the most devastating disease in several major canola producing areas worldwide and the most effective means to control this disease is through the development of disease resistance cultivars. To exploit the blackleg disease resistance genes more efficiently, a dominant disease resistance gene LepR3 in 'Surpass 400' was targeted through map-based gene cloning. Using a previously reported ultradense genetic recombination map with over 13500 sequence-related amplified polymorphism (SRAP) markers as a platform, several SRAP markers on the map were found to be linked closely to the LepR3 gene. After sequencing these SRAP markers and performing BLAST analysis with the sequences, the corresponding syntenic regions in Arabidopsis were pinpointed. Chromosome walking with the syntenic regions as a reference allowed the identification of a gene that encodes a receptor-like kinase with transmembrane and leucine-rich repeats (LRR) domains, bearing the hallmarks of some resistance (R) genes identified in other plant species.

La jambe noire est la maladie la plus destructrice dans plusieurs régions de production de colza du monde entier et les moyens les plus efficaces de lutter contre cette maladie consistent à mettre au point des cultivars résistants à la maladie. Afin d'exploiter les gènes de résistance à la maladie de la jambe noire de manière plus efficace, on a ciblé par clonage positionnel un gène dominant de résistance à la maladie LepR3 chez le 'Surpass 400'. On a découvert, en utilisant comme plate-forme une carte de recombinaison génétique ultradense préalablement établie comprenant plus de 13500 marqueurs de polymorphismes d'amplification liés à la sequence (SRAP), que plusieurs marqueurs SRAP de la carte étaient étroitement liés au gène LepR3. Après avoir séquencé ces marqueurs SRAP et effectué une analyse BLAST des séquences, on a identifié les régions synténiques correspondantes chez Arabidopsis. La marche sur chromosome effectuée en utilisant les régions synténiques comme référence a permis d'identifier un gène qui code une kinase de type récepteur comprenant des domaines transmembranaires et des domaines de répétitions riches en leucine (LRR), portant les marques de certains gènes de résistance (R) identifiés chez d'autres espèces végétales.

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