Identification of bacterial avirulence genes and their...

A - Human Necessities – 61 – K

Patent

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Details

A61K 31/13 (2006.01) A61K 31/44 (2006.01) C12Q 1/18 (2006.01)

Patent

CA 2326391

"Black holes" in the genomes of bacterial pathogens represent deletions of "anti-virulence" genes, i.e. genes that are detrimental to a pathogenic lifestyle. Identification of the missing genetic loci in the "black hole" identifies genes that are incompatible with the bacteria's pathogenicity. These genes, their gene products, and compounds generated by the enzymatic action of these gene products represent potential new compounds that are inhibitory to the bacterial pathogen and thus useful as pharmaceuticals. The utility of this concept is demonstrated in the missing gene for lysine decarboxylase, and the resulting inhibitory activity of cadaverine (the diaminoalkyl reaction product of lysine decarboxylase) on the Shigella enterotoxins. Diaminoalkyl compounds are therefore potent inhibitors of E. toll and Shigella spp, enterotoxins. Lysine decarboxylase generated from the gene cadA results in attenuation of the enterotoxic effects. New methods of use of diaminoalkyl compounds as medicaments are described. New uses of genetic constructs containing a cadA sequence, or other "anti-virulence" gent, for biochemical probes, for toxin receptor identification, and for pharmaceutical discovery are described. Additional uses are described for vaccines and DNA vaccine delivery.

Des "trous noirs" dans les génomes d'agents pathogènes bactériens représentent des délétions de gènes "anti-virulence", c'est-à-dire de gènes nuisibles au style de vie pathogène. L'identification des loci génétiques manquants dans le "trou noir" permet d'identifier les gènes incompatibles avec le pouvoir pathogène des bactéries. Ces gènes, leurs produits géniques et les composés générés par l'action enzymatique de ces produits géniques représentent de nouveaux composés potentiels inhibant l'agent pathogène bactérien et pouvant donc s'utiliser comme produits pharmaceutiques. L'utilité de ce concept est démontrée par le gène manquant de lysine décarboxylase et l'activité inhibitrice consécutive de la cadavérine (le produit de réaction diaminoalkyle de la lysine décarboxylase) sur les entérotoxines Shigella. Les composés diaminoalkyle sont donc de puissants inhibiteurs d'entérotoxines de E. coli et Shigella spp. La lysine décarboxylase générée par le gène cadA provoque une atténuation des effets entérotoxiques. L'invention concerne de nouvelles méthodes d'utilisation de composés diaminoalkyle comme médicaments, ainsi que de nouvelles utilisations de produits de recombinaison génétiques contenant une séquence cadA, ou un autre gène "anti-virulence" dans des sondes biochimiques, pour l'identification d'un récepteur de toxine et dans des découvertes pharmaceutiques. L'invention concerne également d'autres utilisations permettant l'injection de vaccins et de vaccins d'ADN.

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