C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2230893
A method of determining whether or not a particular base is present at a specified position in a nucleic acid sequence. The method comprises the steps of (a) providing a single stranded sample of the sequence to be investigated (the "sample sequence") in immobilised form on a solid support, (b) hybridising a primer to said sample sequence such that the base at the 3' end of the primer is hybridised to that base in the sample sequence which is immediately adjacent to the specified position on the 3' side thereof, (c) treating the primer under extension conditions with a labelled moiety capable of providing an extension unit of the primer at a position corresponding to said specified position in the sample sequence if said particular base is present at that position, the extension conditions being such that any extension of the primer does not continue beyond said specified position of the sample sequence otherwise than by further extension with labelled moiety, (d) washing the support to remove unreacted labelled moiety and other reagents, and (e) testing for incorporation of the labelled moiety in the primer.
L'invention concerne un procédé qui permet de déterminer si une base particulière occupe ou non une position spécifiée dans une séquence nucléotidique. Le procédé comprend les étapes suivantes: (a) immobilisation sur un support solide d'un échantillon monocaténaire de la séquence à analyser ("séquence test"), (b) hybridisation d'une amorce sur ladite séquence test de sorte que la base à l'extrémité 3' de l'amorce soit hybridée à la base de la séquence test immédiatement adjacente à la position spécifiée du côté 3' de la séquence, (c) traitement de l'amorce dans des conditions d'extension au moyen d'un fragment marqué capable de fournir une unité d'extension de l'amorce en une position qui correspond à la position spécifiée dans la séquence test si ladite base particulière est présente à cet emplacement, étant entendu que les conditions d'extension ne doivent pas permettre le prolongement d'une extension de l'amorce au-delà de la position spécifiée dans la séquence test autrement que par une extension supplémentaire à l'aide du fragment marqué, (d) lavage du support pour éliminer le fragment marqué n'ayant pas réagi et d'autres réactifs, et (e) mise à l'essai pour l'incorporation du fragment marqué à l'amorce.
Marks & Clerk
Minter Stephen
Tepnel Medical Limited
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1949292