C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2509098
The invention is directed to methods for angiotyping individual patients to predict the likelihood of whether a given individual will develop good vs. poor collaterals naturally. Accordingly, this can involve obtaining and providing a list of genes involved in collateral development. In particular, angiotyping individual patients can be used to predict the likelihood of whether a given individual will develop good vs. poor collaterals in response to specific angiogenesis therapy. From an array of genes that have been determined through experimental studies as being differentially expressed in tissues in which collaterals are developing in response to arterial occlusion, single nucleotide polymorphisms (SNPs), or other epigenetic changes, such as DNA methylation patterns, can be identified. SNPs and DNA methylation patterns are detected using microchips or similar technology assaying for all, or most, of the genes determined to play a role in collateral development. In addition, abnormally low or abnormally high differential expression of any combination of the candidate genes can be detected in such tissue as peripheral blood cells. The presence of a predisposition to develop poor vs. good collaterals is indicated by the presence of SNPs, and/or alterations in DNA methylation patterns, and/or difference in expression levels involving one or more of the genes.
L'invention concerne des méthodes de "typage angiologique" de patients individuels permettant de déterminer si un individu donné développe naturellement des vaisseaux collatéraux sains/altérés. Plus particulièrement, le "typage angiologique" de patients individuels peut être utilisé pour déterminer si un individu donné développe des vaisseaux collatéraux sains/altérés en réponse à un traitement par angiogenèse spécifique. A partir d'un ensemble de gènes dont on a déterminé, au moyen d'études expérimentales, qu'ils sont exprimés différemment dans les tissus dans lesquels les vaisseaux collatéraux se développent en réponse à une occlusion artérielle, des polymorphismes mononucléotidiques (SNP), ou d'autres modifications épigénétiques, telles que les modifications des profils de méthylation de l'ADN, peuvent être identifiés. Les SNP et les modifications des profils de méthylation de l'ADN sont détectés au moyen de micropuces ou d'une technique similaire permettant d'analyser la plupart ou la totalité des gènes dont on a déterminé qu'ils jouent un rôle dans le développement de vaisseaux collatéraux. En outre, l'expression différentielle anormalement faible ou anormalement élevée d'une combinaison quelconque des gènes candidats peut être détectée dans ce tissu comme caractéristique de cellules sanguines périphériques. Une prédisposition à développer des vaisseaux collatéraux sains/altérés est révélée par la présence de SNP et/ou de modifications des profils de méthylation de l'ADN, et/ou par la différence des niveaux d'expression impliquant un ou plusieurs de ces gènes.
Burnett Mary Susan
Epstein Stephen E.
Bereskin & Parr Llp/s.e.n.c.r.l.,s.r.l.
Medstar Research Institute
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1387364