Identification of proteins in human serum indicative of...

G - Physics – 01 – N

Patent

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G01N 30/06 (2006.01) G01N 30/14 (2006.01) G01N 30/72 (2006.01)

Patent

CA 2699296

A method of identifying proteins present in human serum which are differentially expressed between normal individuals and patients known to have non-small cell lung cancers and asthma, as diagnosed by a physician. Human serum specimens from each population are digested with trypsin or any other suitable endoproteinase and analyzed using a liquid chromatography electrospray ionization mass spectrometer. Mass spectral data from each population is compared to determine proteins with expression intensities which are significantly differentially expressed between the normal, asthma, and lung cancer populations. Eleven proteins are found to have expression intensities which are significantly differentially expressed between the populations. Finally, the identity of the eleven proteins are obtained by comparing the mass spectral data with known databases having libraries of mass spectral data of known proteins.

L'invention concerne un procédé d'identification de protéines présentes dans du sérum humain, qui sont exprimées de manière différentielle entre des individus normaux et des patients diagnostiqués par un médecin comme présentant des cancers du poumon sans petite cellule et de l'asthme. Des échantillons de sérum humain provenant de chaque population sont digérés avec de la trypsine ou toute autre endoprotéinase appropriée et analysés à l'aide d'un spectromètre de masse à ionisation par électronébulisation/chromatographie liquide. Des données spectrales de masse pour chaque population sont comparées afin de déterminer les protéines présentant des intensités d'expression qui sont exprimées de manière significativement différentielle entre les populations normales, les populations asthmatiques et les populations présentant un cancer du poumon. Onze protéines qui présentent des intensités d'expression exprimées de manière significativement différentielle entre les populations ont été découvertes. Enfin, l'identité des onze protéines est obtenue en comparant les données spectrales de masse avec des bases de données connues contenant des bibliothèques de données spectrales de masse de protéines connues.

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