Identifying a target polynucleotide

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2583832

A method for identifying the presence of a single stranded target polynucleotide in a sample comprising the steps of (i) contacting the target polynucleotide, under hybridising conditions, with at least first and second polynucleotide probes, each of which comprise a first region complementary to adjacent non-overlappïng regions of the target polynucleotide; (ii) ligating together those first and second polynucleotides that hybridise to the target polynucleotide; (iii) optionally, amplifying any ligated polynucleotides; and (iv) determining whether the target polynucleotide is present in the original sample, by detecting any ligated polynucleotide, wherein at least one of the first and second polynucleotides comprise a second region having a defined polynucleotide sequence, with each individual nucleotide of the first region being represented by at least two nucleotides on the second region, and the ligated polynucleotide being identified by determining the second region of at least one of the first and second polynucleotide probes.

L'invention concerne une méthode pour identifier la présence d'un polynucléotide cible monocaténaire dans un échantillon. Cette méthode comprend les étapes consistant à: (i) mettre en contact le polynucléotide cible, dans des conditions d'hybridation, avec au moins une première sonde polynucléotidique et une seconde sonde polynucléotidique, chaque sonde comprenant une première zone complémentaire à des zones non superposées adjacentes du polynucléotide cible; (ii) ligaturer le premier polynucléotide et le second polynucléotide qui s'hybrident au polynucléotide cible; (iii) éventuellement amplifier tous polynucléotides ligaturés; et (iv) déterminer si le polynucléotide cible est présent dans l'échantillon d'origine, par la détection de tous polynucléotides ligaturés, au moins le premier polynucléotide et le second polynucléotide comprenant une seconde zone présentant une séquence polynucléotidique définie, chaque nucléotide individuel de la première zone étant représenté par au moins deux nucléotides sur la seconde zone, et le polynucléotide ligaturé étant identifié par la détermination de la seconde zone d'au moins la première sonde polynucléotidique ou la seconde sonde polynucléotidique.

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Profile ID: LFCA-PAI-O-1994185

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