Improved detection of micro-organisms

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/25 (2006.01) A61K 38/48 (2006.01) C12N 9/52 (2006.01) C12Q 1/02 (2006.01) C12Q 1/04 (2006.01) C12Q 1/18 (2006.01)

Patent

CA 2692800

NAD-dependent ligase is identified as an indicator of micro- organisms in a sample. A method of detecting the presence of an NAD-dependent ligase expressing micro-organism in a sample comprises the steps of: (a) contacting the sample with a nucleic acid molecule which acts as a substrate for NAD-dependent ligase activity in the sample, (b) incubating the thus contacted sample under conditions suitable for NAD-dependent ligase activity; and (c) specifically determining the presence of a ligated nucleic acid molecule resulting from the action of the NAD- dependent ligase on the substrate nucleic acid molecule to indicate the presence of the NAD-dependent ligase expressing micro-organism. The method has a number of applications and kits for carrying out the methods are also provided. Lysostaphin preparations substantially free from nuclease and/or ligase contaminants are produced by heating a lysostaphin preparation which contains nuclease and/or ligase contaminants under conditions whereby nuclease and/or ligase activity is reduced whereas endopeptidase activity of the lysostaphin is substantially unaffected.

La présente invention concerne une ligase NAD-dépendante identifiée en tant qu'indicateur de micro-organismes dans un échantillon. Un procédé permettant de détecter la présence dans un échantillon d'une ligase NAD-dépendante exprimant un micro-organisme comprend les étapes consistant à : (a) mettre en contact l'échantillon avec une molécule d'acide nucléique qui agit tel un substrat pour l'activité de la ligase NAD-dépendante dans l'échantillon; (b) incuber l'échantillon mis en contact dans des conditions propices à l'activité de la ligase NAD-dépendante; et (c) déterminer spécifiquement la présence d'une molécule d'acide nucléique ligaturée à la suite de l'action de la ligase NAD-dépendante sur la molécule d'acide nucléique servant de substrat afin d'indiquer la présence de la ligase NAD-dépendante exprimant un micro-organisme. Le procédé présente différentes applications et l'invention porte aussi sur des kits d'application desdits procédés. Des préparations de lysostaphine sensiblement dépourvues de contaminants nucléase et/ou ligase sont obtenues en chauffant une préparation de lysostaphine renfermant des contaminants nucléase et/ou ligase dans des conditions où l'activité de la nucléase et/ou ligase est réduite tandis que l'activité de l'endopeptidase de la lysostaphine demeure sensiblement intacte.

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