C - Chemistry – Metallurgy – 40 – B
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
40
B
C40B 30/10 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C40B 30/04 (2006.01) C40B 40/06 (2006.01) G01N 33/52 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01)
Patent
CA 2545252
The invention provides novel oligonucleotides and methods of using the same for detection or measurement of specific nucleic acid molecules. The invention also features nucleic acid arrays comprising the oligonucleotides of the invention. An oligonucleotide of the invention comprises (1) a reporter- binding sequence capable of hybridizing to a fluorrophore-labeled reporter sequence and (2) a hairpin-forming sequence capable of forming a stem-loop. Formation of the stem-loop modifies (e.g., quenching) the fluorescence signals of the reporter sequence when the reporter sequence is hybridized to the oligonucleotide. This can be achieved, for example, by bringing one or more guanine based in the oligonucleotide into close proximity to the fluorophore(s) of the reporter sequence by virtue of the formation of the stem- loop. Disruption of the stem-loop, such as by hybridization of a target sequence to at least part of the hairpin-forming sequence, produces a detectable change in the fluorescence signals.
La présente invention a trait à de nouveaux oligonucléotides et leurs procédés d'utilisation pour la détection et la mesure de molécules d'acides nucléiques spécifiques. L'invention a également trait à des jeux ordonnés d'échantillons d'acides nucléiques comportant les oligonucléotides de l'invention. Un oligonucléotide de l'invention comporte (1) une séquence de liaison à un gène rapporteur capable d'hybridation à une séquence rapporteuse marquée au fluorophore et (2) une séquence de formation d'épingle à cheveux capable d'une formation tige-boucle. La formation tige-boucle modifie (par exemple, une extinction) des signaux de fluorescence de la séquence rapporteuse lors le l'hybridation de la séquence rapporteuse à l'oligonucléotide. Cela peut se réaliser, par exemple, par le rapprochement d'une ou de plusieurs guanines basées dans l'oligonucléotide au(x) fluorophore(s) de la séquence rapporteuse grâce à la formation tige-boucle. La dissociation de la tige-boucle, telle que par l'hybridation d'une séquence cible à au moins une partie de la séquence formant épingle à cheveux, produit une modification détectable dans les signaux de fluorescence.
Hunter Kenneth W.
Publicover Nelson G.
Tam-Chang Suk-Wah
Gowling Lafleur Henderson Llp
University Of Nevada Reno
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-2015685