In vivo selection of rna-binding peptides

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01)

Patent

CA 2218718

The invention provides methods and kits suitable for large-scale in vivo screening of polypeptides for specific binding affinity to a selected RNA recognition sequence. Polypeptide(s) are screened as fusion proteins with a polypeptide having antitermination activity. Polypeptides having binding activity are identified by their capacity to activate transcription of a reporter gene via binding of the polypeptide being screened to the selected RNA recognition sequence. The invention also provides methods of screening RNA molecules for binding to a selected polypeptide.

Cette invention concerne des procédés et des nécessaires servant au criblage in vivo à grande échelle de polypeptides dotés d'une affinité de liaison spécifique avec une séquence sélectionnée de reconnaissance d'ARN. Les polypeptides font l'objet d'un criblage en tant que protéines hybrides avec un polypeptide ayant une activité d'antiterminaison. Les polypeptides présentant une activité de liaison sont identifiés par leur capacité à activer la transcription d'un gène reporteur par l'intermédiaire de la liaison du polypeptide objet du criblage avec la séquence de reconnaissance d'ARN sélectionnée. Cette invention concerne également des procédés permettant le criblage de molécules d'ARN en ce qui concerne leur liaison avec un polypeptide sélectionné.

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