Information management system for biochemical information

G - Physics – 06 – F

Patent

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Details

G06F 17/30 (2006.01)

Patent

CA 2531131

An information management system for managing biochemical information (200). The biochemical information (200) comprises data sets (202) and each data set comprises a variable value matrix containing variable values organized as rows and columns; a row description list, in a variable description language, of the rows in the variable value matrix; a column description list, in a variable description language, of the columns in the variable value matrix; and a fixed dimension description, in a variable description language, of one or more fixed dimensions that are common to all values in the variable value matrix. A benefit achieved by storing the numerical values as a scalar matrix is that the matrix can be analyzed with many commercially available data- mining tools, such as self-organizing maps or other clustering algorithms, that do not readily process dimensioned values.

L'invention concerne un système de gestion d'informations permettant de gérer des informations biochimiques (200). Ce système comprend : lesdites informations biochimiques (200) qui comportent des ensembles de données (202), chaque ensemble de données comprenant : une matrice de valeurs variables contenant des valeurs variables organisées en colonnes et en rangées ; une liste de description de rangées, dans une langue de description variable, qui décrit les rangées se trouvant dans la matrice de valeurs variables ; une liste de description de colonnes, dans une langue de description variable, qui décrit les colonnes se trouvant dans la matrice de valeurs variables, et ; une description de dimension fixe, dans une langue de description variable, qui décrit une ou plusieurs dimension(s) fixe(s) commune(s) à toutes les valeurs se trouvant dans la matrice de valeurs variables. Stocker les valeurs numériques sous la forme d'une matrice scalaire permet d'analyser cette matrice au moyen d'outils d'exploration de données disponibles dans le commerce, tels que des cartes à auto-organisation ou d'autres algorithmes de groupement, qui ne traitent pas facilement les valeurs dimensionnées.

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