G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 33/68 (2006.01)
Patent
CA 2426728
Arginine-containing cysteine-modifying compounds useful for MALDI-MS analysis of proteins are provided. These compounds termed isotope-coded ionization enhancement reagents (ICIER) can provide ionization enhancement in MALDI-MS, relative quantitation, and additional database searching constraints at the same time without any extra sample manipulation. More specifically, ICIER increase the ionization efficiency of cysteine-containing peptides by attachment of a guanidino functional group. ICIER also increase the overall hydrophilicity of these peptides due the hydrophilic nature of ICIER and thus increase the percentage of recovery of these peptides during sample handling and processing such as in-gel digestion or liquid chromatography. Finally, a combination of both light and heavy ICIER provides an accurate way to obtain relative quantitation of proteins by MALDI-MIS and additional database searching constraints (number of cysteine residues in every single peptide peak) to increase the confidence of protein identification by peptide mass mapping.
La présente invention concerne des composés modificateurs de la cystéine comprenant de l'arginine utiles dans l'analyse de protéines par spectrométrie de masse à désorption-ionization par impact laser assistée par matrice (MALDI-MS). Ces composés appelés réactifs activateurs d'ionisation à code isotopique (RAICI) peuvent produire une activation d'ionisation dans l'analyse MALDI-MS, une quantification relative, et des contraintes additionnelles à la recherche dans les bases de données supplémentaire simultanément sans manipulation additionnelle d'échantillons. Plus spécifiquement, les RAICI accroissent l'efficacité de l'ionisation de peptides contenant de la cystéine par la fixation d'un groupe fonctionnel guanidino. Les RAICI accroissent également l'hydrophilie globale de ces peptides en raison de la nature hydrophile des RAICI et accroissent ainsi le pourcentage de récupération de ces peptides en cours de manipulation et de traitement d'échantillons comme par exemple dans la digestion en gel ou la chromatographie liquide. Enfin, une association de RAICI légers et lourds fournit un moyen précis d'obtention d'une quantification relative de protéines par analyse MALDI-MS et de contraintes additionnelles à la recherche dans les bases de données (nombre de résidus de cystéine dans chaque pic de peptide individuel) afin d'augmenter la fiabilité de l'identification de protéines par la cartographie de masse de peptides.
Hewick Rodney M.
Qiu Yongchang
Wang Jack H.
Genetics Institute Llc.
Norton Rose Or S.e.n.c.r.l. S.r.l./llp
LandOfFree
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