Laser microdissection and microarray analysis of breast...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2603898

About 70% to 80% of breast cancers express estrogen receptor-.alpha. (ERa), and estrogens play important roles in the development and growth of hormone- dependent tumors. Together with lymph node metastasis, tumor size and histological grade, ER status is considered one of the prognostic factors in breast cancer, and an indicator for hormonal treatment. 147 genes and 112 genes with significant P- value and having significant differential expression between ER+ and ER- tumors were identified from the LCM data set and bulk tissue data set, respectively. 61 genes were found to be common in both data sets, while 85 genes were unique to the LCM data set and 51 genes were present only in the bulk tumor data set. Pathway analysis with the 85 genes using Gene Ontology suggested that genes involved in endocytosis, ceramide generation, Ras/ERK/Ark cascade, and JAT- STAT pathway may play roles related to ER. The gene profiling with LCM-captured tumpr cells provides a unique approach to characterize and study epithelial tumor cells and to gain an insight into signaling pathways associated with ER.

Environ 70 % à 80 % de cancers du sein expriment le récepteur .alpha. d'oestrogène (RE.alpha.), et des oestrogènes jouent un rôle important dans le développement et la croissance de tumeurs dépendantes des hormones. Conjointement avec la métastase de ganglion lymphatique, la dimension tumorale et le grade histologique, le statut de RE est considéré comme un des facteurs de pronostic dans le cancer du sein, et un indicateur pour le traitement hormonal. 147 gènes et 112 gènes avec une valeur importante de P et présentant une importante expression différentielle entre des tumeurs RE+ et RE- ont été identifiés à partir d'ensemble de données de microdissection par capture laser (LCM) et d'ensemble de données de masse tissulaire, respectivement 61 gènes se sont avérés communs aux deux ensembles de données, alors que 85 gènes étaient uniques à l'ensemble de données LCM et 51 gènes étaient uniquement présents dans l'ensemble de données de masse tissulaire. L'analyse de voies avec les 85 gènes au moyen de l'ontologie génétique a suggéré que les gènes impliqués dans l'endocytose, la génération de céramides, la cascade Ras/ERK/Ark, et la voie JAT-STAT peuvent jouer des rôles associés au RE. L'établissement de profils génétiques des cellules tumorales capturées fournissent une technique unique pour la caractérisation et l'étude de cellules tumorales épithéliales et permet d'avoir une meilleure connaissance de voies associées au RE.

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