Lcm (laser capture microdissection) for cellular protein...

G - Physics – 01 – N

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G01N 33/68 (2006.01) B01L 3/00 (2006.01) G01N 1/28 (2006.01) G01N 1/30 (2006.01)

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CA 2359649

The present invention describes devices and methods for performing protein analysis on laser capture microdissected cells, which permits proteomic analysis on cells of different populations. Particular disclosed examples are analysis of normal versus malignant cells, or a comparison of differential protein expression in cells that are progressing from normal to malignant. The protein content of the microdissected cells may be analyzed using techniques such as immunoassays, 1D and 2D gel electrophoresis characterization, Western blotting, liquid chromatography quadrapole ion trap electrospray (LCQ-MS), Matrix Assisted Laser Desorption Ionization/Time of Flight (MALDI/TOF), and Surface Enhanced Laser Desorption Ionization Spectroscopy (SELDI). In addition to permitting direct comparison of qualitative and quantitative protein content of tumor cells and normal cells from the same tissue sample, the methods also allow for investigation of protein characteristics of tumor cells, such as binding ability and amino acid sequence, and differential expression of proteins in particular cell populations in response to drug treatment. The present methods also provide, through the use of protein fingerprinting, a rapid and reliable way to identify the source tissue of a tumor metastasis.

La présente invention concerne des dispositifs et des procédés d'analyse protéique de cellules ayant subi une microdissection par capture au laser, permettant l'analyse protéomique de cellules provenant de populations variées. Des exemples particuliers de cette invention se rapportent à l'analyse de cellules normales par rapport aux cellules malignes, ou à la comparaison de l'expression protéique différentielle dans des cellules évoluant de l'état normal à l'état malin. La teneur protéique des cellules microdisséquées peut être analysée avec des techniques comme le dosage immunologique, la caractérisation par électrophorèse unidimensionnelle et bidimensionnelle en gélose, le "Western blotting", l'électronébulisation à piégeage d'ions quadrupôles par chromatographie liquide (LCQ-MS), la désorption-ionisation par impact laser assistée par matrice/ temps de vol (MALDI/TV), la spectroscopie à ionisation/désorption avec exaltation de surface (SELDI). Par ailleurs, en plus de permettre la comparaison directe entre la teneur qualitative et quantitative protéique des cellules tumorales et normales provenant d'un même prélèvement tissulaire, ces procédés permettent également la recherche des caractéristiques protéiques des cellules tumorales, comme par exemple la capacité de liaison et la séquence d'acide aminé, et l'expression différentiée des protéines dans des populations de cellules particulières en réponse à un traitement par des médicaments. Grâce aux empreintes protéiques, ces procédés constituent un moyen efficace et rapide d'identification du tissu responsable de métastases.

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