C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
07
H
C07H 23/00 (2006.01) C07H 19/06 (2006.01) C07H 19/16 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01)
Patent
CA 2241222
A linker arm for solid support oligonucleotide synthesis, the linker arm comprising formula (1), wherein: X1 is selected from the group consisting of - O-, -S-, -S(O)2-, -C(O)- and -N(R12)-; R12 is selected from the group comprising hydrogen, a substituted or unsubstituted C1-C20 alkyl group, a substituted or unsubstituted C5-C30 aryl group and a substituted or unsubstituted C5-C40 alkaryl group, X3 is -O- or -N(H)-; R1, R2, R3, R4 and R5 are the same or different and are selected from the group consisting of hydrogen, halide, a substituted or unsubstituted C1-C20 alkyl group, a substituted or unsubstituted C5-C30 aryl group and a substituted or unsubstituted C5-C40 alkylaryl group; n is 0, 1 or 2; and one of A' and B' is selected from the group consisting of hydrogen, halide, a substituted or unsubstituted C1-C20 alkyl group, a substituted or unsubstituted C5-C30 aryl group and a substituted or unsubstituted C5-C40 alkylaryl group, and the other of A' and B' has formula (2), wherein X2 is selected from the group consisting of -O-, -S-, -S(O)2- and -N(R13)-; R13 is selected from the group comprising hydrogen, a substituted or unsubstituted C1-C20 alkyl group, a substituted or unsubstituted C5-C30 aryl group and a substituted or unsubstituted C5-C40 alkaryl group; R6 and R7 are the same or different and are selected from the group consisting of hydrogen, halide, a substituted or unsubstituted C1-C20 alkyl group, a substituted or unsubstituted C5-C30 aryl group and a substituted or unsubstituted C5-C40 alkylaryl group; p is 0 or 1; and m is 0, 1 or 2. A process for producing the linker arm is also disclosed. The linker arm is useful in solid support oligonucleotide synthesis and is characterized by a desirable combination of stability against spontaneous hydrolysis and ease of intentional cleavage of the synthesized oligonucleotide from the linker arm.
L'invention concerne un bras de liaison pour la synthèse d'oligonucléotides sur un support solide. Le bras de liaison a la formule (1). Dans cette formule, X?1¿ est -O-, -S-, -S(O)¿2?-, -C(O)- ou -(N(R?12¿)-; R?12¿ est un hydrogène, un groupe C¿1?-C¿20? alkyle substitué ou non, un groupe C¿5?-C¿30? aryle substitué ou non ou un groupe C¿5?-C¿40? alkylaryle substitué ou non; X?3¿ est -O- ou -N(H)-; R?1¿, R?2¿, R?3¿, R?4¿ et R?5¿ sont les mêmes ou différents et ce sont l'hydrogène, un halogénure, un groupe C¿1?-C¿20? alkyle substitué ou non, un groupe C¿5?-C¿30? aryle substitué ou non ou un groupe C¿5?-C¿40? alkylaryle substitué ou non; n vaut 1 ou 2; un des deux groupes A' et B' est l'hydrogène, un halogénure, un groupe C¿1?-C¿20? alkyle substitué ou non, un groupe C¿5?-C¿30? aryle substitué ou non ou un groupe C¿5?-C¿40? alkylaryle substitué ou non; et l'autre des deux groupes A' et B' a la formule (2). Dans cette formule, X?2¿ est -O-, -S-, -S(O)¿2?- ou -(N(R?13¿)-; R?13¿ est un hydrogène, un groupe C¿1?-C¿20? alkyle substitué ou non, un groupe C¿5?-C¿30? aryle substitué ou non ou un groupe C¿5?-C¿40? alkylaryle substitué ou non; R?6¿ et R?7¿ sont les mêmes ou différents et ce sont l'hydrogène, un halogénure, un groupe C¿1?-C¿20? alkyle substitué ou non, un groupe C¿5?-C¿30? aryle substitué ou non ou un groupe C¿5?-C¿40? alkylaryle substitué ou non; p est 0 ou 1; m est 0, 1 ou 2. L'invention concerne également un procédé pour former le bras de liaison. Le bras de liaison est utile pour la synthèse d'oligonucléotides sur un support solide et il est caractérisé par une combinaison souhaitable de stabilité contre l'hydrolyse spontanée et facilité de séparation, du bras de liaison, de l'oligonucléotide synthétisé.
Pon Richard T.
Yu Shuyuan
Gowling Lafleur Henderson Llp
University Technologies International Inc.
LandOfFree
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