C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2422752
The invention pertains to a method for identifying one or more regions within a genome of an organism of interest that mediate the expression of one or more genes of interest. The method comprises identifying a first and a second organism of interest, the first organism of interest is characterized by exhibiting a measurable response to an environmental stimulus, or otherwise exhibiting a phenotype associated with differential gene expression associated with a process of interest. The second organism of interest is characterized by lacking or not exhibit as strong a response to the stimulus as that observed within the first organism of interest, or it exhibits a different phenotype compared with that of the first organism of interest, wherein the different phenotype is associated with the process of interest, or it exhibits a phenotype of interest that segregates when compared with the first organism of interest, or a combination thereof. The first and second organisms of interest are crossed to produce a population of segregated progeny and RNA is extracted from each of the segregated progeny. The level of gene expression for one or more genes of interest that are associated with the response to an environmental stimulus, or process of interest is quantified.
La présente invention concerne un procédé d'identification d'une ou de plusieurs régions au sein d'un génome d'un organisme d'intérêt contrôlant l'expression d'un ou de plusieurs gènes d'intérêt. Le procédé comporte l'identification d'un premier et d'un deuxième organismes d'intérêt, le premier organisme d'intérêt est caractérisé en ce qu'il présente un réaction mesurable à un stimulus ambiant, ou en ce qu'il présente un phénotype associé à l'expression génique différentielle liée à un procédé d'intérêt. Le deuxième organisme d'intérêt est caractérisé en ce qu'il ne possède pas ou ne présente pas une réaction aussi forte au stimulus que celle observée au sein du premier organisme d'intérêt, ou il présente un phénotype différent par rapport à celui du premier organisme, dans lequel le phénotype différent est associé au procédé d'intérêt, ou il présente un phénotype d'intérêt distinct par rapport au premier organisme d'intérêt, ou une combinaison de ces caractéristiques. Les premier et deuxième organismes d'intérêt sont soumis à un croisement pour produire une descendance distincte et on extrait l'ARN de chacune des descendances distinctes. On quantifie le niveau de l'expression génique pour un ou plusieurs gènes d'intérêt qui sont associés à la réaction à un stimulus ambiant, ou un procédé d'intérêt. On élabore une carte de liaisons des descendances distinctes à l'aide d'un ou de plusieurs marqueurs, et on détermine la relation entre ledit un ou lesdits plusieurs marqueurs sur la carte de liaisons et l'expression génique d'un ou de plusieurs gènes d'intérêt et on identifie un ou plusieurs loci quantitatifs (QTL). Le procédé a trait également à l'identification d'un ou de plusieurs loci quantitatifs (QTL) associés à un ou à plusieurs gènes d'intérêt dans la descendance distinctes qui sont soumis à un stimulus ambiant souhaité. En outre. Le procédé peut être utilisé pour l'identification d'un ou de plusieurs loci quantitatifs (QTL) correspondant au facteur de transcription ou tout facteur de la régulation de l'expression d'un ou de plusieurs gènes d'intérêt, et on peut isoler et caractériser ledit un ou lesdits plusieurs gènes situés audit un ou auxdits plusieurs loci quantitatifs (QTL).
Castonguay Yves
Laberge Serge
Landry Benoit S.
Monroy Antonio F.
O'donoughue Louise S.
Dna Landmarks Inc.
Gowling Lafleur Henderson Llp
Her Majesty The Queen In Right Of Canada As Represented By The M
LandOfFree
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