Marker assisted directed evolution

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2706801

The present invention is directed at a novel method to enhance the genetic improvement of industrial microorganisms. More specifically, the present invention is directed at molecular methods for the identification of genetic variants that contribute to the genetic improvement of the microorganisms. The methods of the present invention comprise novel approaches for identifying genetic markers that linked to said genetic variants, and for using said genetic markers to select improved industrial microorganisms. In one of the embodiments, the genetic markers linked to said genetic variants are identified in microbial populations that are subjected to directed evolution. In another embodiment the genetic markers linked to said genetic variants are identified in microbial sub populations that have been prescreened for improved characteristics. The primary benefits of the use of the methods of the present invention include the speeding up of the directed evolution process for the genetic improvement of industrial microorganisms and the enhancement of the improvement itself. Indeed the improved industrial microorganisms obtained with the methods of the present invention are superior over those obtained by conventional methods because the methods allow more beneficial genetic variants to be combined together in a single genetic improvement step. Finally, it is anticipated that the methods of the present invention can be utilized on any industrial microorganism for which natural genetic diversity is available, including bacteria, yeasts, fungi and algae.

La présente invention porte sur un nouveau procédé d'augmentation de l'amélioration génétique de microorganismes industriels. Plus spécifiquement, la présente invention porte sur des procédés moléculaires pour l'identification de variants génétiques qui contribuent à l'amélioration génétique des microorganismes. Les procédés de la présente invention comprennent de nouvelles approches d'identification de marqueurs génétiques qui sont liés auxdits variants génétiques, et d'utilisation desdits marqueurs génétiques pour sélectionner des microorganismes industriels améliorés. Dans l'un des modes de réalisation, les marqueurs génétiques liés auxdits variants génétiques sont identifiés dans des populations microbiennes qui sont soumises à une évolution dirigée. Dans un autre mode de réalisation, les marqueurs génétiques liés auxdits variants génétiques sont identifiés dans des sous-populations microbiennes qui ont été précriblées en fonction de caractéristiques améliorées. Les principaux avantages de l'utilisation des procédés de la présente invention comprennent l'accélération du processus d'évolution dirigée pour l'amélioration génétique de microorganismes industriels et l'augmentation de l'amélioration elle-même. En effet, les microorganismes industriels améliorés obtenus par les procédés de la présente invention sont supérieurs à ceux obtenus par des procédés classiques parce que les procédés permettent à des variants génétiques plus avantageux d'être combinés ensemble dans une étape d'amélioration génétique unique. Finalement, il est prévu que les procédés de la présente invention puissent être utilisés sur n'importe quel microorganisme industriel pour lequel une diversité génétique naturelle est disponible, comprenant les bactéries, les levures, les champignons et les algues.

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