Mass spectrometric methods for biomolecular screening

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01)

Patent

CA 2322019

The present invention provides methods for the determination of the structure of biomolecular targets, as well as the site and nature of the interaction between ligands and biomolecular targets. The present invention also provides methods for the determination of the relative affinity of a ligand for the biomolecular target it interacts with. Also provided are methods for screening ligand or combinatorial libraries of compounds against one or more than one biological target molecules. The methods of the invention also allow determination of the relative binding affinity of combinatorial and other compounds for a biomolecular target. The present invention further provides methods for the use of mass modifying tags for screening multiple biomolecular targets. In a preferred embodiment, ligands which have great specificity and affinity for molecular interaction sites on biomolecules, especially RNA can be identified. In preferred embodiments, such identification can be made simultaneously with libraries of ligands.

Procédés de détermination de la structure de cibles biomoléculaires, ainsi que du site et de la nature de l'interaction entre ligands et cibles biomoléculaires. La présente invention concerne également des procédés de détermination de l'affinité relative d'un ligand pour la cible biomoléculaire avec laquelle il est en interaction, ainsi que des procédés de criblage de bibliothèques de ligands ou combinatoires de composés contre une ou plusieurs molécules cibles biologiques. Les procédés selon la présente invention permettent en outre la détermination de l'affinité de liaison relative de composés combinatoires et autres pour une cible biomoléculaire. La présente invention concerne encore des procédés d'utilisation de marqueurs modifiant la masse pour le criblage de cibles moléculaires multiples. Dans un mode de réalisation préféré, les ligands qui ont une grande spécificité et une grande affinité pour des sites d'interaction moléculaires sur des biomolécules, en particulier de l'ARN, peuvent être identifiés. Dans des modes de réalisation préférés, cette identification peut être effectuée en même temps que des bibliothèques de ligands.

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