G - Physics – 06 – F
Patent
G - Physics
06
F
G06F 17/00 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)
Patent
CA 2422700
Methods, apparatus and systems for identifying a biological sample that generate a data set indicative of the composition of the biological sample are provided. In a particular example, the data set is DNA spectrometry data received from a mass spectrometer. The data set is denoised, and a baseline is deleted. Since possible compositions of the biological sample may be known, expected peak areas may be determined. Using the expected peak areas, a residual baseline is generated to further correct the data set. Probable peaks are then identifiable in the corrected data set, which are used to identify the composition of the biological sample. In a disclosed example, statistical methods are employed to determine the probability that a probable peak is an actual peak, not an actual peak, or that the data are too inconclusive to call.
L'invention concerne des procédés, dispositif et systèmes d'identification d'un échantillon biologique, lesquels produisent un ensemble de données indiquant la composition de cet échantillon. Dans un exemple en particulier, l'ensemble de données est constitué de données de spectrométrie d'ADN reçues à partir d'un spectromètre de masse. Le procédé consistant à supprimer le bruit dans l'ensemble des données, à effacer une ligne de base, puis, étant donné que des compositions possibles de l'échantillon biologique peuvent être connues, à déterminer des zones de crête attendues, et à l'aide de ces zones de crête attendues, à produire une ligne de base résiduelle, aux fins de correction ultérieure de l'ensemble de données. Dans l'ensemble de données corrigées, des crêtes probables peuvent être identifiées, qui sont utilisées pour l'identification de la composition de l'échantillon biologique. Dans un exemple décrit, des méthodes statistiques sont employées aux fins de détermination de la probabilité qu'une crête probable est une crête réelle, n'est pas une crête réelle, ou que les données sont trop peu décisives pour une identification.
Sequenom Inc.
Smart & Biggar
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1779264