Method and system for detecting oligonucleotides in a sample

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2353562

The present invention provides a method and a system for the detection of a target oligonucleotide in a sample. The method comprises, in general, the steps of providing a sensor device having a sensing interface carrying capturing oligonucleotides having each a nucleotide sequence complementary in at least a portion thereof to a first portion of the target oligonucleotide; providing verification oligonucleotides having each a nucleotide sequence complementary in at least a portion thereof to a second portion of the target oligonucleotide, other than the first portion; contacting the sample with the sensing interface under conditions so as to allow the target oligonucleotides, if present in the sample, to hybridize to the capturing oligonucleotides; prior to contacting the sample with the sensing interface or thereafter, allowing the verification oligonucleotides to hybridize to the target oligonucleotides if present in the sample; and detecting the presence of the verification oligonucleotides on the sensing interface. The detection of the verification oligonucleotides being indicative to the presence of the target nucleotide in the sample.

La présente invention concerne un procédé et un système permettant de détecter un oligonucléotide cible dans un échantillon. Ce précédé consiste généralement à fournir un dispositif de capteur comportant une interface de détection supportant des oligonucléotides de capture possédant chacun une séquence de nucléotides complémentaire, dans au moins une partie de cette dernière, d'une première partie de l'oligonucléotide cible. Ce procédé consiste à fournir les oligonucléotides de vérification comportant chacun une séquence de nucléotides complémentaire dans au moins une partie de cette dernière, d'une deuxième partie de l'oligonucléotide cible, autre que la première partie. Après avoir permis aux oligonucléotides de vérification de s'hybrider aux oligonucléotides cibles présents dans l'échantillon, ce procédé consiste ensuite à mettre l'échantillon en contact avec l'interface de détection dans des conditions permettant aux oligonucléotides cibles, le cas échéant, de s'hybrider aux oligonucléotides de capture. Enfin, ce procédé consiste à détecter la présence d'oligonucléotides de vérification sur l'interface de détection, ce qui correspond à la présence de nucléotides cibles dans l'échantillon.

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