G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 30/86 (2006.01) G06F 17/00 (2006.01) G06F 17/14 (2006.01)
Patent
CA 2689363
The present invention relates to a method, a computer tool and a system for detecting peptide peaks in measurement signals (11) generated by HPLC-MS instruments. The method comprises the steps of: providing an intensity column vector (SIC) representative of the elution values at a specific mass value (m/z) of the measurement signal (11); performing a wavelet decomposition (15) of such values of said intensity column vector (SIC) to generate a first processed vector (16) representative of the smoothed intensity values of the intensity column vector (SIC); providing a threshold value (S) and performing a wavelet decomposition (17) as a function of the value of said threshold (S) to generate the second processed vector (18) representative of said intensity column vector (SIC) cleaned of any oscillations generated by stochastic noise (e(t)); processing said first processed vector (16) and said second processed vector (18) to generate a third processed vector (19) identifying the baseline values of said intensity column vector (SIC); processing said intensity column vector (SIC) and said second (18) and third (19) vectors to generate e filtered vector (20) identifying any peak value (ZJ) below the background noise (12).
La présente invention porte sur un procédé, un outil informatique et un système pour détecter des pics de peptide dans des signaux de mesure (11) générés par des instruments HPLC-MS. Le procédé comprend les étapes consistant à : se procurer un vecteur de colonne d'intensité (SIC) représentatif des valeurs d'élution à une valeur de masse spécifique (m/z) du signal de mesure (11); effectuer une décomposition d'ondelette (15) de ces valeurs dudit vecteur de colonne d'intensité (SIC) pour générer un premier vecteur traité (16) représentatif des valeurs d'intensité lissées du vecteur de colonne d'intensité (SIC); fournir une valeur seuil (S) et effectuer une décomposition d'ondelette (17) en fonction de la valeur dudit seuil (S) pour générer le second vecteur traité (18) représentatif dudit vecteur de colonne d'intensité (SIC) nettoyé de toutes oscillations générées par un bruit stochastique (e(t)); traiter ledit premier vecteur traité (16) et ledit second vecteur traité (18) pour générer un troisième vecteur traité (19) identifiant les valeurs de ligne de base dudit vecteur de colonne d'intensité (SIC); traiter ledit vecteur de colonne d'intensité (SIC) et lesdits second (18) et troisième (19) vecteurs pour générer un vecteur filtré (20) identifiant toute valeur de pic (ZJ) au-dessous du bruit de fond (12).
Cappadona Salvatore
Cerutti Sergio
James Peter
Levander Fredrik
Pattini Linda
Oyen Wiggs Green & Mutala Llp
Politecnico Di Milano
LandOfFree
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