Method and system for general purpose analysis of...

G - Physics – 06 – T

Patent

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Details

G06T 7/60 (2006.01)

Patent

CA 2359467

Methods and system for general purpose analysis of images acquired from experimental data collected with automated feature-rich, high-throughput experimental data collection systems. A set of pre-determined general assay features is presented. An assay feature includes one or more measurements for an object in a digital photographic image acquired from the experimental data. The set of pre-determined general assay features includes object features, aggregate features and general purpose image processing features. A set of desired assay features is selected from the set of features. A set of images is processed using the desired assay features from the selected set of assay features. The methods and system help provide a general purpose assay development tool. The methods and system allow a biologist, other scientist or lab technician not trained in image processing techniques to quickly and easily design protocols and assays to analyze images acquired from experimental data (e.g., cells). The methods and system may improve the identification, selection, validation and screening of new drug compounds that have been applied to populations of cells. The methods and system may also be used to provide new bioinformatic techniques to manipulate experimental data including multiple digital photographic images.

L'invention concerne des procédés et un système pour analyser de manière polyvalente des images acquises à partir de données expérimentales recueillies au moyen de systèmes automatisés de collecte de données expérimentales présentant de nombreuses caractéristiques et à productivité élevée. L'invention porte également sur une série de caractéristiques d'analyse générales prédéterminées. Une caractéristique d'analyse comprend une ou plusieurs mesures pour un objet situé dans une image photographique numérisée obtenue au moyen des données expérimentales. La série de caractéristiques d'analyse générales prédéterminées comprend les caractéristiques d'objet, d'agrégat et de traitement d'images polyvalent. Une série de caractéristiques d'analyse désirées est choisie parmi la série de caractéristiques. Une série d'images est traitée au moyen des caractéristiques d'analyse désirées choisies parmi la série de caractéristiques d'analyse. Les procédés et le système permettent d'obtenir un outil polyvalent de mise au point d'analyses. Les procédés et le système permettent à un biologiste, à d'autres scientifiques ou laborantins non qualifiés en matière de techniques de traitement d'images de concevoir rapidement et facilement des protocoles et des analyses permettant d'analyser des images obtenues au moyen des données expérimentales (par exemple, les cellules). Les procédés et le système peuvent améliorer l'identification, la sélection, la validation et le criblage de nouveaux composés pharmaceutiques qui ont été appliqués à des populations de cellules. Ils peuvent également fournir de nouvelles techniques bio-informatiques pour manipuler des données expérimentales, y compris de nombreuses images photographiques numérisées.

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Profile ID: LFCA-PAI-O-1760031

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