C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/09 (2006.01)
Patent
CA 2489196
The invention relates to a method and test kit for quantitative determination of the amounts or relative proportions of polynucleotides in a mixture. The invention enables assessment of dynamic variations in a mixed population of organisms using affinity aided solution hybridization. The test kit comprises organized pools of polynucleotide probes having approximately the same number of nucleotides, which are distinguishable using resolution enabling tags providing the probes with different sizes. The resolution enabling tags may simultaneously act as tracer, affinity or primer tags. The probes are allowed to hybridize with affinity tagged analyte polynucleotides. The result is hybrids, recoverable on separation aiding tools provided with counterparts of the affinity tag. After the quantitative release of the probes, the individual probes can be amplified and recorded. The method and test kit are useful for determining hygienic and epidemiologic situations and evaluating the effect of antibiotic treatment and sanitary measures.
L'invention porte sur un procédé et sur un kit de test pour la détermination quantitative de quantité ou proportions relatives de polynucléotides dans un mélange. Cette invention permet d'évaluer des variations dynamiques dans une population mixte d'organismes par l'hybridation en solution grâce à l'affinité. Le kit de test comprend des ensembles organisés de sondes polynucléotidiques ayant approximativement le même nombre de nucléotides pouvant se distinguer par des étiquettes activant la résolution formant les sondes de différentes tailles. Les étiquettes activant la résolution peuvent simultanément agir comme étiquettes traceurs, d'affinité ou d'amorce. Les sondes sont autorisées à s'hybrider avec des polynucléotides d'analytes marqués par affinité. On obtient des hybrides récupérables sur des outils facilitant la séparation pourvus des contreparties de l'étiquette d'affinité. Après la libération quantitative des sondes, les sondes individuelles peuvent être amplifiées ou enregistrées. Ce procédé et le kit de test sont utiles pour déterminer des situations sanitaires et épidémiologiques et évaluer les effets du traitement antibiotique et des mesures sanitaires.
Kataja Kari
Satokari Reetta
Soederlund Hans
Takkinen Kristiina
Bereskin & Parr Llp/s.e.n.c.r.l.,s.r.l.
Valtion Teknillinen Tutkimuskeskus
LandOfFree
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