G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 33/574 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01)
Patent
CA 2724433
The invention relates to a method for the determination of a cancer diagnostic/therapeutic biomarker assay and drug-targets including the following steps: (a) identification of potential candidate protein/peptide biomarkers and drug-targets based on the measurement of protein/peptide constituent concentrations in tissue sample proteomes as well as serum, plasma or any other derivatives of blood, or blood itself sample proteomes derived from healthy non-human mammalian individuals as well as from cancerous non-human mammalian individuals and qualitatively selecting as potential candidate protein/peptide biomarkers those which show a pronounced differential behaviour between healthy and cancerous sample proteomes; (b) optional verification of the potential candidate protein/peptide biomarkers as identified in step (a) by quantitative mass spectrometric measurement of the potential candidate protein biomarkers in serum, plasma or any other derivatives of blood, or blood itself sample proteomes derived from healthy non-human mammalian individuals as well as from cancerous non-human mammalian individuals and selecting as candidate protein/peptide biomarkers those which show a mass- spectrometrically measurable quantitative differential behaviour between healthy and cancerous sample proteomes; (c) validation of the candidate protein/peptide biomarkers as identified in step (a), or as optionally verified in step (b), by mass spectrometric measurement and/or antibody-based assays such as an Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) determination of the candidate protein biomarkers in serum, plasma or any other derivatives of blood, or blood itself sample proteomes derived from healthy human individuals as well as from cancerous human individuals and selecting as protein/peptide biomarkers those which show a mass-spectrometrically measurable and/or antibody- based assay detectable differential behaviour between healthy and cancerous sample proteomes; (d) application of statistical meth-ods to uncover single or groups of protein/peptide biomarkers as validated in step (c) as signatures for the detection of patients with cancer. The invention furthermore relates to specific biomarker assays for the highly reliable diagnosis of cancer, specifically of localized or non-localized prostate cancer, using human serum, plasma or any other derivatives of blood, or blood itself.
L'invention concerne un procédé permettant la détermination d'un dosage de biomarqueurs de diagnostic/thérapeutique d'un cancer et cibles de médicaments incluant les étapes suivantes : (a) l'identification de biomarqueurs peptidiques/protéiques candidats potentiels et de cibles de médicaments sur la base de la mesure des concentrations des constituants protéiques/peptidiques dans des protéomes d'échantillon de tissu ainsi que dans des protéomes d'échantillon de sérum, de plasma et des autres dérivés du sang, ou de sang lui-même dérivés d'individus mammifères non humains sains ainsi que d'individus mammifères non humains cancéreux et en sélectionnant de manière qualitative comme biomarqueurs peptidiques/protéiques candidats potentiels ceux qui présentent un comportement différentiel prononcé entre les protéomes d'échantillons cancéreux et sains ; (b) la vérification éventuelle des biomarqueurs peptidiques/protéiques candidats potentiels tels qu'identifiés dans l'étape (a) par mesure quantitative par spectrométrie de masse des biomarqueurs protéiques candidats potentiels dans des protéomes d'échantillon de sérum, de plasma et des autres dérivés du sang, ou de sang lui-même dérivés d'individus mammifères non humains sains ainsi que d'individus mammifères non humains cancéreux et en sélectionnant de manière qualitative comme biomarqueurs peptidiques/protéiques candidats potentiels ceux qui présentent un comportement différentiel quantitative mesurable par spectrométrie de masse entre les protéomes d'échantillons cancéreux et sains ; (c) la validation des biomarqueurs protéiques/peptidiques candidats tels qu'identifiés dans l'étape (a) ou tels qu'éventuellement vérifiés dans l'étape (b), par mesure par spectrométrie de masse et/ou par des dosages d'anticorps tel qu'un dosage par la méthode immuno-enzymatique (ELISA) des biomarqueurs protéiques candidats dans des protéomes d'échantillon de sérum, de plasma et des autres dérivés du sang, ou de sang lui-même dérivés d'individus humains sains ainsi que d'individus humains cancéreux et en sélectionnant comme biomarqueurs peptidiques/protéiques ceux qui présentent un comportement différentiel mesurable par spectrométrie de masse et/ou détectable par dosage basé sur les anticorps entre les protéomes d'échantillons cancéreux et sains ; (d) l'application de méthodes statistiques pour découvrir un simple ou des groupes de biomarqueurs protéiques/peptidiques tels que validés dans l'étape (c) comme signatures en vue de la détection de patients atteints d'un cancer. L'invention concerne en outre des dosages de biomarqueurs spécifiques permettant le diagnostic très fiable d'un cancer, en particulier le cancer de la prostate localisé ou non localisé, en utilisant le sérum, le plasma ou les autres dérivés du sang ou le sang lui-même d'humain.
Aebersold Rudolf
Cerny Thomas
Cima Igor
Gillessen Silke
Krek Wilhelm
Cassan Maclean
Eth Zuerich
Kantonsspital St. Gallen
LandOfFree
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