Method for characterising polynucleotides

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2522418

The method of the invention is used to identify specific characteristics of a target polynucleotide in a sample, and comprises the steps of: i) attaching to one end of each target polynucleotide in the sample a polynucleotide signal sequence that is specific for the characteristic under study; ii) contacting the target polynucleotides with a molecule that interacts with the target polynucleotide if the characteristic is present; iii) attaching a polynucleotide adapter sequence to those targets polynucleotides that interact with the molecule of step (ii), the adapter being attached at the end of the target polynucleotide opposite that at which the signal sequence is attached; iv) carrying out a polynucleotide amplification reaction on those target polynucleotides that comprise both the adapter and signal sequence, optionally repeating steps (i) to (iv) for other characteristics; and (v) identifying which signal sequences are present on the amplified products, and in which order, to thereby determine the characteristics of each target polynucleotide.

La présente invention sert à l'identification de caractéristiques spécifiques d'un polynucléotide cible dans un échantillon, et comprend les étapes suivantes : i) la fixation à une extrémité de chaque polynucléotide cible dans l'échantillon d'une séquence-signal de polynucléotide spécifique à la caractéristique étudiée ; ii) la mise en contact des polynucléotides cibles avec une molécule qui interagit avec le polynucléotide cible si la caractéristique est présente ; iii) la fixation d'une séquence adaptatrice de polynucléotide à ces polynucléotides cibles qui interagissent avec la molécule de l'étape (ii), la séquence adaptatrice étant fixée à l'extrémité du polynucléotide cible opposée à celle à laquelle est fixée la séquence-signal ; iv) la réalisation d'une réaction d'amplification de polynucléotide sur ces polynucléotides qui comprennent la séquence adaptatrice et la séquence-signal ; éventuellement la répétition des étapes (i) à (iv) pour d'autres caractéristiques ; et (v) l'identification de quelles séquences-signal sont présentes sur les produits amplifiés, et dans quel ordre, pour ainsi déterminer les caractéristiques de chaque polynucléotide cible.

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