Method for detecting cell proliferative disorders

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01)

Patent

CA 2275865

The present invention relates to the detection of a cell proliferative disorder associated with alterations of microsatellite DNA in a sample. The microsatellite DNA can be contained within any of a variety of samples, such as urine, sputum, bile, stool, cervical tissue, saliva, tears or cerebral spinal fluid. The invention is a method to detect an allelic imbalance by assaying microsatellite DNA. Allelic imbalance is detected by observing an abnormality in an allele, such as an increase or decrease in microsatellite DNA which is at or corresponds to an allele. An increase can be detected as the appearance of a new allele. In practicing the invention, DNA amplification methods, particularly polymerase chain reactions, are useful for amplifying the DNA. DNA analysis methods can be used to detect such a decrease or increase. The invention is also a method to detect genetic instability of microsatellite DNA. Genetic instability is detected by observing an amplification or deletion of the small, tandem repeat DNA sequences in the microsatellite DNA which is at or corresponds to an allele. The invention is also a kit for practicing these methods.

La présente invention concerne la détection d'un dérèglement prolifératif cellulaire associé à des modifications de l'ADN microsatellite dans un échantillon. L'ADN microsatellite peut être contenu dans n'importe quel échantillon d'une variété d'échantillons tels que l'urine, les crachats, la bile, les selles, le tissus cervical, la salive, les larmes ou le liquide céphalo-rachidien. L'invention est un procédé de détection d'un déséquilibre allélique par dosage d'ADN microsatellite. Un déséquilibre allélique est détecté par l'observation d'une anomalie dans un allèle, telle qu'une augmentation ou une diminution de l'ADN microsatellite se trouvant au niveau d'un allèle ou correspondant à un allèle. Une augmentation peut être détectée comme étant l'apparition d'un nouvel allèle. Dans la mise en pratique de l'invention, des procédés d'amplification d'ADN, notamment l'amplification en chaîne par polymérase, sont utiles pour l'amplification de l'ADN. On peut utiliser des procédés d'analyse d'ADN afin de détecter une telle diminution ou augmentation. L'invention est également un procédé de détection d'instabilité génétique de l'ADN microsatellite. Une instabilité génétique est détectée par observation d'une amplification ou d'une délétion des petites séquences d'ADN à répétitions en tandem dans l'ADN microsatellite, au niveau d'un allèle ou correspondant à un allèle. L'invention concerne également un kit de mise en pratique de ces procédés.

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