C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) A61K 38/16 (2006.01) B01J 19/00 (2006.01) C07K 16/00 (2006.01) C12M 1/34 (2006.01) C12M 1/40 (2006.01) G01N 33/00 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/543 (2006.01) G01N 33/566 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01)
Patent
CA 2442367
Methods for detecting the presence of at least one, usually a plurality of, DNA binding proteins, e.g., transcription factors, in a sample, both qualitatively and quantitatively, are provided. In the subject methods, a substrate having one or more DNA probes immobilized on a surface thereof, one for each DNA binding protein of interest, is contacted with a sample under conditions sufficient for binding complexes of the probes and their respective DNA binding proteins to be produced. The sample may be purified with respect to one or more DNA binding proteins or be a cellular/nuclear extract. Resultant binding complexes on the surface of the substrate are then detected and related to the presence of the DNA binding protein-DAN interations of interest in the sample. Also provided are devices and systems for use in practicing the subject methods. The subject methods find use in a variety of different applications, e.g., detecting the presence of a transcription factor in a sample, the study of transcription factor profiles in response to a given stimulus, screening for therapeutic agents, and the like.
La présente invention concerne des procédés qui permettent de détecter, qualitativement et quantitativement, la présence dans un échantillon, d'au moins une protéine de liaison à l'ADN et en général de plusieurs de ces mêmes protéines, par exemple des facteurs de transcription. Dans les procédés selon l'invention, on met en contact un substrat sur la surface duquel est immobilisée au moins une sonde ADN, une pour chaque protéine de liaison à l'ADN recherchée, avec un échantillon dans des conditions suffisantes pour produire les complexes de liaison des sondes et de leurs protéines de liaison à l'ADN respectives. L'échantillon peut être purifié pour ce qui concerne une ou plusieurs protéines de liaison à l'ADN ou bien peut être un extrait cellulaire/nucléaire. Les complexes de liaison résultants situés à la surface du substrat sont ensuite détectés et mis en relation avec la présence des interactions protéines de liaison à l'ADN-ADN recherchées dans l'échantillon. Cette invention concerne également des dispositifs et des systèmes destinés à être utilisés pour mettre en oeuvre les procédés selon l'invention. Ces mêmes procédés peuvent être utilisés dans une grande diversité d'applications différentes, telles que par exemple pour détecter la présence d'un facteur de transcription dans un échantillon, pour étudier les profils du facteur de transcription en réponse à un stimulus donné, pour cribler des agents thérapeutiques et autres.
Fang Yu
Turpin Pierre
Wang Xiao-Yang
Clontech Laboratories Inc.
Smart & Biggar
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1871690