G - Physics – 06 – F
Patent
G - Physics
06
F
G06F 17/18 (2006.01) G06F 17/00 (2006.01) G06F 17/16 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)
Patent
CA 2447857
A method, system, computer program selecting attribute sets of characterizing attributes of an object, selecting an attribute set of attributes of interest, assigning a likelihood for each characterized attribute set that the attribute set occurs when the attribute set of interest occurs (each likelihood determined using Bayesian computable classifiers on a dataset of attributes for actual samples), comparing each assigned likelihood against likelihood thresholds, and reporting the assigned likelihoods of the characterizing attribute set based on the likelihood thresholds. Markers may be identified for diagnosis and prognosis. Characterizing attributes may be gene expression levels and the attribute of interest may be drug sensitivity level, drug dose (absolute concentration or dose relative to some standard dose), dose of drug which causes half-maximal cellular growth rate, or logarithm base 10 (dose) where dose is the dose which yields half-maximal total cell mass accumulating.
L'invention concerne un procédé, un système et un programme informatique destinés à sélectionner des ensembles d'attributs de caractérisation d'un objet, à sélectionner un ensemble d'attributs d'intérêt, à déterminer la probabilité, pour chaque ensemble d'attributs de caractérisation, de voir un ensemble d'attributs intervenir lorsque cet ensemble d'attributs d'intérêt intervient (chaque probabilité étant déterminée au moyen de classificateurs calculables bayésiens sur un ensemble de données d'attributs pour des échantillons actuels), à comparer chaque probabilité déterminée avec des seuils de probabilité, puis à faire rapport des probabilités déterminées de l'ensemble d'attributs de caractérisation sur la base de ces seuils de probabilité. Les attributs de caractérisation peuvent représenter les niveaux d'expression génétique. L'attribut d'intérêt, quant à lui, peut représenter le degré de sensibilité au médicament, la dose médicamenteuse (dose ou concentration absolue par rapport à une dose standard donnée), la dose de médicament impliquant un taux de croissance cellulaire demi-maximal, ou la base logarithmique (dose) avec laquelle la dose permet une accumulation de masse cellulaire totale demi-maximale.
Ableson Alan D.
Green James
Kotlyar Max
Somogyi Roland
Steeg Evan W.
Parteq Research And Development Innovations
Wilkes Robert H.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1949739