Method for determining the allergic potential of a compound

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2664843

The present invention is related to a method for determining the sensitizing potential of a chemical (test) compound, comprising the steps of : (a) Providing a test sample and a control sample, (b) Exposing said samples to a chemical compound, (c) Determining for the test sample and the control sample a gene expression pattern, (d) Looking up in a database the gene expression pattern for a set of control and test samples.

La présente invention concerne une méthode de détermination du pouvoir sensibilisant d'un composé (d'essai) chimique, qui consiste à: a) utiliser une culture cellulaire appropriée d'un type cellulaire spécifique et utiliser un échantillon d'essai et un échantillon de contrôle de celle-ci, l'échantillon d'essai et l'échantillon de contrôle étant identiques; b) exposer l'échantillon d'essai à un composé chimique dans un solvant et exposer l'échantillon de contrôle audit solvant pendant une durée préétablie; c) déterminer pour l'échantillon d'essai et l'échantillon de contrôle des expressions génétiques xi pour un sous-ensemble de i=1 par rapport à n gènes sélectionnés dans le groupe de gènes correspondant aux séquences SEQ ID Nos 1 à 153; d) pour ce sous-ensemble de n gènes; rechercher dans une base de données d'expressions génétiques xi un ensemble d'échantillons de contrôle et d'essai, les échantillons d'essai étant exposés, pendant ladite durée préétablie, à un ensemble de composés modèles de sensibilisation chimique comprenant à la fois des sensibilisants et des non sensibilisants; e) utiliser les expressions génétiques de l'échantillon d'essai et de l'échantillon de contrôle de l'étape c) comme données d'entrée dans un modèle de classification statistique fondé sur cette base de données, lequel modèle est éprouvé et optimisé pour classer les composés chimiques soit dans la classe des sensibilisants, soit dans la classe des non sensibilisants, en utilisant les expressions génétiques xi pour ledit sous-ensemble de n gènes; et f) prédire, à l'aide de ce modèle, si le composé chimique testé appartient à la classe de sensibilisants ou à celle des non sensibilisants.

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