Method for determining transcription factor activity and its...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01) C07C 309/15 (2006.01)

Patent

CA 2346364

Certain transcription factors (enhancer binding proteins) significantly increase transcription rates from genes by nicking a single DNA strand in the vicinity of their DNA binding sites, thereby allowing RNA polymerase to gain access to the transcribed DNA strand by a process of "threading". DNA template nicking is a detectable and quantifiable byproduct indicative of transcriptional activation that can be used to design practical assays. These assays are used to determine which transcription factors (enhancer binding proteins) are actively catalyzing the transcription of a gene in any cell type, or in any cell in response to any drug or treatment. This group of transcription factors have a predictable molecular biological activity in addition to transcription activation, namely site-specific DNA strand cleavage.

L'invention porte sur certains facteurs de transcription (renforçateur de protéines de liaison) qui augmentent considérablement les taux de transcription à partir de gènes en cassant un brin d'ADN unique à proximité de leurs sites de liaison avec l'ADN, ce qui permet à la polymérase d'ADN d'avoir accès au brin d'ADN transcrit par un procédé de "taraudage". La cassure de la matrice d'ADN est un sous-produit détectable et quantifiable indiquant l'activation transcriptionnelle qui peut être utilisée pour concevoir des dosages pratiques. Ces dosages sont utilisés pour déterminer quels sont les facteurs de transcription (renforçateur de protéines de liaison) qui catalysent activement la transcription d'un gène dans tout type de cellule ou dans toute cellule réagissant à un médicament ou traitement. Ce groupe de facteurs de transcription a une activité biologique moléculaire prévisible en même temps que l'activation de transcription, à savoir un clivage de brin d'ADN spécifique d'un site.

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