Method for identifying validated target and assay combinations

G - Physics – 01 – N

Patent

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G01N 33/50 (2006.01) C12N 1/15 (2006.01) C12N 1/19 (2006.01) C12N 1/21 (2006.01) C12N 5/16 (2006.01) C12Q 1/02 (2006.01)

Patent

CA 2317653

The invention comprises methods useful within a larger process for identifying compounds and/or designing further compounds with activity to produce a desired phenotype (for example, growth inhibition) in cells whose target cell component is the subject of certain studies to identify such compounds. The invention employs constructed cells comprising a regulable gene encoding a biomolecule which modulates (inhibits or activates) in vivo the function of a target component of the cell which can be an enzyme for example. The process incorporates methods for identifying biomolecules that bind to a chosen target cell component in vitro, methods for identifying biomolecules that also bind to the chosen target and modulate its function intracellularly, causing a phenotypic effect. The intracellular effect of a biomolecule can be tested in cell culture, or tested after introduction of the constructed cells into a host mammal in vivo, and methods for identifying compounds that compete with the biomolecules for sites on the target in competitive binding assays. Compounds identified by the series of steps in this process are candidates for drugs with the desired activity on the cell. Targets for which such compounds can be identified are validated as being essential to a phenotype of the cell.

L'invention concerne des méthodes permettant, dans le cadre d'un processus plus général, d'identifier des composés et/ou de concevoir de nouveaux composés dont l'activité est destinée à produire le phénotype souhaité (par exemple d'inhibition de la croissance) dans des cellules dont le composant cellulaire cible est le sujet de certaines études, qui visent à identifier les composés susmentionnés. Cette invention utilise des cellules construites, renfermant un gène pouvant être régulé codant pour une biomolécule qui module (inhibe ou active) in vivo la fonction d'un composant cible de ladite cellule, par exemple une enzyme. Le processus de cette invention comprend des méthodes d'identification des biomolécules qui se lient in vitro à un composant cellulaire cible choisi, ainsi que des méthodes d'identification des biomolécules qui se lient également à la cible choisie et qui modulent sa fonction de manière intracellulaire, provoquant ainsi un effet phénotypique. L'effet intracellulaire d'une biomolécule peut être testé dans une culture cellulaire, ou après l'introduction desdites cellules construites dans un mammifère hôte in vivo. Cette invention concerne également des méthodes d'identification des composés qui entrent en compétition avec des biomolécules pour des sites de la cible dans des dosages par liaison compétitive. Les composés identifiés au cours des différentes étapes de ce processus sont potentiellement des médicaments présentant l'activité voulue sur la cellule. Les cibles de ces composés ainsi identifiés sont validées comme étant essentielles à un phénotype de la cellule.

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