G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 33/68 (2006.01)
Patent
CA 2757996
The present invention provides a method for quantifying modified peptides in a sample, the method comprising: (a) obtaining peptides from the sample; (b) adding reference modified peptides to the peptides obtained in step (a) to produce a mixture of peptides and reference modified peptides; (c) carrying out mass spectrometry (MS) on said mixture of peptides and reference modified peptides to obtain data relating to the peptides in the sample; and (d) comparing the data relating to the peptides in the sample with data in a database of modified peptides using a computer programme; wherein the database of modified peptides is compiled by a method comprising: (i) obtaining peptides from a sample; (ii) enriching modified peptides from the peptides obtained in step (i); (iii) carrying out liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC- MS/MS) on the enriched modified peptides obtained in step (ii); (iv) comparing the modified peptides detected in step (iii) to a known reference database in order to identify the modified peptides; and (v) compiling data relating to the modified peptides identified in step (iv) into a database.
La présente invention porte sur un procédé de quantification de peptides modifiés dans un échantillon, le procédé comprenant : (a) l'obtention de peptides à partir de l'échantillon ; (b) l'ajout de peptides modifiés de référence aux peptides obtenus à l'étape (a) pour produire un mélange de peptides et de peptides modifiés de référence ; (c) la réalisation d'une spectrométrie de masse (MS) sur ledit mélange de peptides et de peptides modifiés de référence pour obtenir des données portant sur les peptides dans l'échantillon ; et (d) la comparaison des données portant sur les peptides dans l'échantillon avec des données dans une base de données de peptides modifiés à l'aide d'un programme informatique, la base de données de peptides modifiés étant compilée par un procédé comprenant : (i) l'obtention de peptides à partir d'un échantillon ; (ii) l'enrichissement de peptides modifiés à partir des peptides obtenus à l'étape (i) ; (iii) la réalisation d'une chromatographie liquide et d'une spectrométrie de masse en tandem (LC-MS/MS) sur les peptides modifiés enrichis obtenus à l'étape (ii) ; (iv) la comparaison des peptides modifiés détectés à l'étape (iii) avec une base de données de référence connues afin d'identifier les peptides modifiés ; et (v) la compilation des données portant sur les peptides modifiés identifiés à l'étape (iv) dans une base de données.
Rodriguez Cutillas Pedro
Vanhae Sebroeck Bart
Queen Mary & Westfield College
Smart & Biggar
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1896788