G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 21/78 (2006.01) G01N 21/27 (2006.01) G01N 21/93 (2006.01) G02B 21/24 (2006.01) G06K 9/00 (2006.01) G06T 7/00 (2006.01) G06T 7/60 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)
Patent
CA 2460801
A method of determining an amount of at least one molecular specie comprising a sample is provided, each molecular specie being indicated by a dye. The amount of the molecular specie is determined from an image of the sample captured as image data by a color image acquisition device in a video- microscopy system. An optical density of the sample is first determined in each of a red, green, and blue channel at a particular pixel in the image. A corresponding optical density matrix is thereafter formed for that pixel. The optical density matrix is then multiplied by the inverse of a relative absorption coefficient matrix so as to form a resultant matrix for the pixel. The relative absorption coefficient matrix comprises a relative absorption coefficient for each dye, independently of the sample, in each of the red, green, and blue channels. The resultant matrix thus comprises the amount of each molecular specie, as indicated by the respective dye, for that pixel. Associated systems and computer software program products are also provided.
L'invention concerne un procédé permettant de déterminer une quantité d'au moins une espèce moléculaire comprenant un échantillon, chaque espèce moléculaire étant indiquée par un colorant. La quantité de l'espèce moléculaire est déterminée à partir d'une image de l'échantillon capturée en tant que données d'image, par un dispositif d'acquisition d'image couleur, dans un système de vidéo-microscopie. Une densité optique de l'échantillon est d'abord déterminée dans chaque canal rouge, vert, et bleu, au niveau d'un pixel particulier de l'image. Une matrice de densité optique correspondante est ensuite formée pour ce pixel. Cette matrice de densité optique est ensuite multipliée par l'inverse d'une matrice de coefficient d'absorption relatif, de sorte à former une matrice résultante pour ce pixel. Cette matrice de coefficient d'absorption relatif comprend un coefficient d'absorption relatif pour chaque colorant, indépendamment de l'échantillon, dans chaque canal rouge, vert, et bleu. Cette matrice résultante comprend ainsi la quantité de chaque espèce moléculaire, comme indiquée par le colorant respectif, pour ce pixel. L'invention concerne également des systèmes et des produits de programme de logiciel informatique.
Gahm Thomas
Marcelpoil Raphael
Ridout & Maybee Llp
Tripath Imaging Inc.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1665752