G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 21/78 (2006.01) G01N 15/14 (2006.01) G01N 21/31 (2006.01) G01N 21/91 (2006.01) G01N 33/483 (2006.01) G06T 7/00 (2006.01) G06T 7/40 (2006.01)
Patent
CA 2473848
A method of determining an amount of at least one molecular species in a sample from an image of the sample captured by an image acquisition device is provided, each molecular species being indicated by a dye. A dye space representation of a plurality of dyes is formed by orthogonally adding the correspondence tables of the dyes, each correspondence table having a plurality of normalized RGB triplets and incrementally extending from 0% to 100% transmittance. The dye space representation has one dimension for each dye and provides a reference model for a combination of the plurality of dyes. Each pixel of an image of the sample stained with the combination of the plurality of dyes is compared to the reference model, each pixel having a color defined by an RGB triplet, so as to determine an optimal combination of normalized RGB triplets from the respective correspondence tables of the dyes producing the color of the respective pixel. An artificial image of the sample is then formed from the normalized RGB triplets for each dye as determined from the optimal combination. The artificial image thereby indicates a distribution of the respective dye over the sample image and facilitates determination of the amount of the corresponding molecular species. Associated methods, systems, and computer software program products are also provided.
L'invention concerne un procédé permettant de déterminer la quantité d'au moins une espèce moléculaire dans un échantillon à partir d'une image de cet échantillon capturée au moyen d'un dispositif d'acquisition d'image, chaque espèce moléculaire étant signalée par un colorant. Une représentation d'espace pour colorant d'une pluralité de colorants est formée par adjonction orthogonale des tables de correspondance de ces colorants, chaque table de correspondance comprenant une pluralité de triplets RGB normalisés et s'étendant par incrémentation d'une transmittance de 0 % à 100 %. La représentation d'espace pour colorant présente une dimension pour chaque colorant, et fournit un modèle de référence pour une combinaison de colorants. Chaque pixel d'une image de l'échantillon coloré au moyen de la combinaison de colorants est comparé au modèle de référence, chacun des pixels possédant une couleur définie pour un triplet RGB afin de déterminer une combinaison optimale de triplets RGB normalisés à partir des tables de correspondance respectives des colorants produisant la couleur du pixel respectif. Une image artificielle de l'échantillon est ensuite formée à partir des triplets RGB normalisés pour chaque colorant tels que déterminés à partir d'une combinaison optimale. Cette image artificielle indique ainsi une répartition du colorant respectif sur l'image de l'échantillon et facilite la détermination de la quantité d'espèces moléculaires correspondantes. L'invention concerne également des procédés et des systèmes associés ainsi que des produits de programme logiciel informatique.
Marcelpoil Raphael
Morel Didier
Ridout & Maybee Llp
Tripath Imaging Inc.
LandOfFree
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