G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 33/48 (2006.01)
Patent
CA 2578028
A computer-assisted method for identifying functionalities to add to an organism-specific metabolic network to enable a desired biotransformation in a host includes accessing reactions from a universal database to provide stoichiometric balance, identifying at least one stoichiometrically balanced pathway at least partially based on the reactions and a substrate to minimize a number of non-native functionalities in the production host, and incorporating the at least one stiochiometrically balanced pathway into the host to provide the desired biotransformation. A representation of the metabolic network as modified can be stored.
L'invention se rapporte à un procédé assisté par ordinateur d~identification des fonctionnalités à ajouter à un réseau métabolique spécifique à un organisme pour permettre une bio- transformation souhaitée chez un hôte comprenant l~accès à des réactions depuis une base de données universelle en vue de fournir un équilibre stAEchiométrique, l'identification d'au moins une voie stAEchiométriquement équilibrée basée au moins partiellement sur les réactions et un substrat pour minimiser un certain nombre de fonctionnalités non natives chez l'hôte de production, et l'incorporation d'au moins une voie stAEchiométriquement équilibrée dans l'hôte pour fournir la bio- transformation souhaitée. Une représentation du réseau métabolique ainsi modifié peut être mémorisée.
Burgard Anthony P.
Maranas Costas D.
Pharkya Priti
Bereskin & Parr Llp/s.e.n.c.r.l.,s.r.l.
The Penn State Research Foundation
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1960636