G - Physics – 06 – F
Patent
G - Physics
06
F
G06F 19/18 (2011.01) G06F 19/22 (2011.01)
Patent
CA 2750225
Provided herein are methods for evaluating associations between candidate genes and a trait of interest in a population. The methods include a combination of genome-wide association analysis and one or both of nested association mapping (NAM), and expression QTL analysis (eQTL). Markers are selected or prioritized if they are shown to be positively-correlated with a trait of interest using GWA and a combination of one or both of NAM and eQTL. Also provided are models for evaluating the association between a candidate marker and a trait in a nested population of organisms. These methods include single marker regression and multiple marker regression models. Markers identified using the methods of the invention can be used in marker assisted breeding and selection, as genetic markers for constructing linkage maps, for gene discovery, for identifying genes contributing to a trait of interest, and for generating transgenic organisms having a desired trait.
L'invention porte sur des procédés d'évaluation d'associations entre des gènes candidats et une caractéristique d'intérêt dans une population. Les procédés comprennent une combinaison d'une analyse d'association dans tout le génome et d'un ou des deux parmi un mappage d'association imbriqué (NAM) et une analyse QTL d'expression (eQTL). Des marqueurs sont sélectionnés ou priorisés s'ils sont reconnus comme étant positivement corrélés à une caractéristique d'intérêt à l'aide de GWA et d'une combinaison de l'un ou des deux parmi NAM et eQTL. L'invention porte également sur des modèles d'évaluation de l'association entre un marqueur candidat et une caractéristique dans une population imbriquée d'organismes. Ces procédés comprennent des modèles de régression à marqueur unique et de régression à multiples marqueurs. Des marqueurs identifiés à l'aide des procédés de l'invention peuvent être utilisés dans le développement et la sélection assistés par marqueur, en tant que marqueurs génétiques pour construire des cartes de liaison, pour une découverte de gènes, pour identifier des gènes contribuant à une caractéristique d'intérêt, et pour générer des organismes transgéniques présentant une caractéristique voulue.
Byrum Joseph
Clarke Joseph Dallas V.
Guo Zhigang
Gutierrez Rojas Libardo Andres
Kishore Venkata Krishna
Fetherstonhaugh & Co.
Syngenta Participations Ag
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1381916