Method for the detection of cytosine methylations in...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2462932

A method for the detection of cytosine methylation in immobilised DNA samples is disclosed. In the first method step the genomic DNA is isolated from cells or other associated material and boned essentially irreversibly to a surface. The DNA bonded to the surface is then preferably treated with a bisulphite such that cytosine is converted into a base different from the base pairing relationship in the DNA duplex, whilst 5-methylcytosine remains unaltered. The used reagents are then removed in a washing step. Finally, selected sections of the immobilised DNA are amplified in a polymerase reaction and the amplificate examined with regard to the sequence thereof.

L'invention concerne un procédé d'analyse de modèles de méthylation de cytosine dans des échantillons d'ADN génomique. Dans une première étape, l'ADN génomique prélevé dans des cellules ou autres matières d'accompagnement est isolé et lié à une surface de manière sensiblement irréversible. Puis l'ADN lié à la surface est traité, de préférence, par un hydrogénosulfite de telle manière que la cytosine soit transformée en une base différente du comportement d'appariement de bases dans l'ADN duplexe, tandis que la 5-méthylcytosine demeure inchangée. Ensuite, les réactifs utilisés sont éliminés par une opération de lavage. Enfin des sections sélectionnées de l'ADN immobilisé sont amplifiées dans une réaction de polymérase et la séquence des produits d'amplification est examinée.

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