Method for the identification of pharmacophores

G - Physics – 01 – N

Patent

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G01N 33/68 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)

Patent

CA 2473593

The invention relates to a computer system and a method for the identification of a molecular pharmacophore with the following steps: Input of descriptors for substances, whereby each descriptor comprises a number of variables (V1, V2, ..., Vn) and input of the results (Rp) associated with said descriptors, determination of binary variations for pairs of variables, assignment of a variable pair (Vi, Vj) to an active entity of the pharmacophore, said active entity comprising exactly two variables when the binary variation of the variable pair amounts to two, determination of tertiary variations for triplets of variables (Vi, Vj, Vk), determination of variable pair candidates from the tertiary variations for assignment to a common active entity, said common active entity comprising two or more variables, determination of a number of variables for each variable pair candidate, containing said variables, which, on allocation of the variable pair candidates to the common active entity, must be allocated to an active entity different to the common active entities and determination of a conflict-free cluster of the numbers of variables for identification of the common active entity.

La présente invention concerne un système informatique et un procédé pour identifier un pharmacophore moléculaire. Ce procédé consiste à entrer des descripteurs de substances, chaque descripteur présentant un certain nombre de variables (V¿1?, V¿2?, ..., V¿n?), à entrer des effets (R¿p?) associés aux descripteurs, à déterminer des variations binaires pour des paires de variables, à attribuer une paire de variables (V¿i?, V¿j?) à une unité active du pharmacophore qui présente exactement deux variables lorsque la variation binaire de la paire variable vaut deux, à déterminer des variations ternaires en triplets de variables (V¿i?, V¿j?, V¿k?), à déterminer des candidats aux paires de variables à partir des variations ternaires, afin de les attribuer à une unité active commune qui présente deux ou plusieurs variables, à déterminer une quantité de variables pour chaque candidat aux paires de variables contenant des variables qui, lors de l'attribution du candidat aux paires de variables à l'unité active commune, doivent être attribuées à une unité active différente de l'unité active commune, puis à déterminer un groupe sans conflit des quantités de variables, afin d'identifier l'unité active commune.

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