C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C07K 7/06 (2006.01) C07K 14/74 (2006.01) A61K 39/00 (2006.01)
Patent
CA 2266456
The present invention provides a method for typing of alleles of the Minor Histocompatibility Antigen HA-1 in a sample, with said method comprising: a) contacting the genomic polynucleic acids in the sample with at least one pair of primers, whereby the 5'- and/or the 3'-primer of said at least one pair of primers specifically hybridize to target regions comprising polymorphic nucleotides in said alleles, and performing an amplification reaction; b) for each of said at least one pair of primers detecting whether or not in step a) an amplification product is formed; c) inferring from the result of step b) which HA-1 allele is present in said sample. The present invention also provides a method for genomic typing of alleles of the Minor Histocompatibility Antigen HA-1 in a sample, with said method comprising: a) amplifying a fragment of said alleles, with said fragment comprising at least one polymorphic nucleotide, by use of at least one pair of primers specifically hybridizing to conserved target regions in said alleles; b) hybridizing the amplified product of step a) to at least one probe specifically hybridizing to a target region comprising one or more polymorphic nucleotides in said allele; c) inferring from the result of step b) which HA-1 allele is present in said sample. In addition, the present invention provides primers and probes for use in the above-mentioned methods. Diagnostic kits enabling said methods are also provided.
L'invention a pour objet un procédé de typage des allèles de l'antigène mineur d'histocompatibilité HA-1 dans un échantillon. Le procédé consiste: (a) à mettre en contact les acides polynucléiques génomiques présents dans l'échantillon avec au moins une paire d'amorceurs, l'amorceur 5' et/ou 3' de ladite paire d'amorceurs s'hybridant de manière spécifique avec des régions cibles qui comprennent des nucléotides polymorphes dans lesdits allèles, et à effectuer une réaction d'amplification; (b) à détecter, pour chaque paire d'amorceurs, si un produit d'amplification s'est formé ou non au stade (a); et (c) à déduire des résultats du stade (b) le type d'allèle de HA-1 présent dans l'échantillon. L'invention concerne également un procédé de typage génomique d'allèles de l'antigène mineur d'histocompatibilité HA-1 dans un échantillon. Ce procédé consiste: (a) à amplifier un fragment desdits allèles, ce fragment comprenant au moins un nucléotide polymorphe, au moyen d'au moins une paire d'amorceurs s'hybridant de manière spécifique avec des régions cibles conservées dans lesdits allèles; (b) à hybrider le produit amplifié du stade (a) avec au moins un essai s'hybridant de manière spécifique avec une région cible comprenant un ou plusieurs nucléotides polymorphes dans ledit allèle; et (c) à déduire des résultats du stade (b) le type d'allèle de HA-1 présent dans l'échantillon. En outre, l'invention concerne des amorceurs et des essais utilisés dans les procédés ci-décrits, ainsi que des kits de diagnostic permettant de mettre en oeuvre ces procédés.
Goulmy Els
Borden Ladner Gervais Llp
Rijksuniversiteit Leiden
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-2013152