Method of altering polypeptide aggregation

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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C12N 15/12 (2006.01) A61K 38/17 (2006.01) A61P 25/00 (2006.01) C07K 14/47 (2006.01) C07K 14/54 (2006.01) C12N 9/12 (2006.01) C12N 9/14 (2006.01) C12N 9/48 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01) C12N 15/63 (2006.01) A61K 38/00 (2006.01)

Patent

CA 2385123

The present invention provides a method of designing a modified polypeptide having an altered tendency to aggregate compared to the unmodified polypeptide. The method comprises: analysing the amino acid sequence of a predetermined polypeptide to determine the propensity of the polypeptide to form local structure; comparing the propensity to form local structure of a modified polypeptide to the propensity to form local structure of an unmodified polypeptide; and determining thereby whether the modified polypeptide has an altered tendency to aggregate in the denatured state relative to the unmodified polypeptide. A selected modified polypeptide having the altered tendency to aggregate is then produced. The invention also provides a method of producing a modified polypeptide having an altered tendency to aggregate compared to the unmodified polypeptide, which method comprises: (i) introducing at least one amino acid modification into a predetermined polypeptide sequence such that said modified polypeptide has an altered propensity to form local structure in the denatured state relative to the unmodified polypeptide, and optionally (ii) recovering the modified polypeptide, and/or optionally (iii) allowing the modified polypeptides to form an aggregate.

La présente invention concerne une méthode de conception d'un polypeptide modifié possédant une tendance altérée à s'agréger, par rapport au polypeptide non modifié. Cette méthode consiste à analyser la séquence d'acides aminés d'un polypeptide déterminé afin de déterminer sa propension à former une structure locale ; à comparer la propension à former une structure locale d'un polypeptide modifié à celle d'un polypeptide non modifié ; et à déterminer par là si le polypeptide modifié possède une tendance altérée à s'agréger dans l'état dénaturé par rapport au polypeptide non modifié. On produit alors un polypeptide modifié sélectionné possédant cette tendance altérée à s'agréger. L'invention concerne également un procédé de production d'un polypeptide modifié présentant une tendance modifiée à s'agréger par rapport au polypeptide non modifié, consistant à : (i) introduire au moins une modification d'acides aminés dans une séquence polypeptidique déterminée, de manière que le polypeptide modifié possède une propension altérée à former une structure locale dans l'état dénaturé par rapport au polypeptide non modifié, et éventuellement (ii) à récupérer le polypeptide modifié, et/ou éventuellement (iii) à permettre aux polypeptides modifiés de former un agrégat.

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Profile ID: LFCA-PAI-O-2016161

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