Method of directing biosynthesis of specific polyketides

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – P

Patent

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Details

C12P 19/62 (2006.01) C07H 17/08 (2006.01) C12N 1/21 (2006.01) C12N 15/52 (2006.01)

Patent

CA 2100791

A method to produce novel polyketide structures by designing and introducing specified changes in the DNA governing the synthesis of the polyketide is disclosed. The biosynthesis of specific polyketide analogs is accomplished by genetic manipulation of a polyketide-producing microorganism by isolating a polyketide biosynthetic gene-containing DNA sequence, identifying enzymatic activities associated within the DNA sequence, introducing one or more specified changes into the DNA sequence which codes for one of the enzymatic activities which results in an altered DNA sequence, introducing the altered DNA sequence into the polyketide-producing microorganism to replace the original sequence, growing a culture of the altered microorganism under conditions suitable for the formation of the specific polyketide analog, and isolating the specific polyketide analog from the culture. The method is most useful when the segment of the chromosome modified is involved in an enzymatic activity associated with polyketide biosynthesis, particularly for manipulating polyketide synthase genes from Saccarharopolyspora or Streptomyces.

Procédé de production de nouvelles structures de polycétides dans lequel on détermine et on introduit des modifications prédéterminées dans l'ADN commandant la synthèse du polycétide. On effectue la biosynthèse d'analogues de polycétides spécifiques en modifiant un microorganisme producteur de polycétide par manipulation génétique en isolant une séquence d'ADN contenant un gène biosynthétique de polycétide, en identifiant les activités enzymatiques associées au sein de la séquence d'ADN, en introduisant une ou plusieurs modifications prédéterminées dans la séquence d'ADN qui code une des activités enzymatiques produisant une séquence d'ADN modifiée, en introduisant cette séquence d'ADN modifiée dans le microorganisme producteur de polycétide à la place de la séquence d'origine, en cultivant le microorganisme modifié dans des conditions adaptées à la formation de l'analogue du polycétide spécifique, puis en isolant l'analogue du polycétide spécifique de cette culture. Ce procédé est plus particulièrement utile lorsque le segment du chromosome modifié est impliqué dans une activité enzymatique associée à la biosynthèse du polycétide, plus spécifiquement pour manipuler des gènes de polycétide synthase provenant du genre Saccharapolyspora ou du genre Streptomyces.

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