Method of managing the chemotherapy of patients who are hiv...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/70 (2006.01) C12Q 1/37 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2244735

A method of managing HIV chemotherapy of patients who are HIV positive comprises transfecting a cell line susceptible to infection by HIV with a sequence, preferably that coding for RT and protease, from the pol gene of HIV obtained from a patient and a HIV-DNA construct from which the sequence has been deleted, culturing the transfected cells so as to create a stock of chimeric viruses, assessing the phenotypic sensitivity of the chimeric viruses to an inhibitor of the enzyme encoded by the pol gene of HIV and assigning a value thereto, constructing a data set comprising the value for chimeric virus sensitivity and the corresponding value for a chimeric wild-type strain of HIV, repeating the sensitivity assessment for at least two further inhibitors and thereby constructing at least three such data sets in total, representing the data sets in two-dimensional or three-dimensional graphical form such that the difference between the chimeric and wild-type sensitivities in the case of each data set provides a visual measure of the resistance of the chimeric stock to treatment by the inhibitor in question, and selecting the optimum inhibitor(s) on the basis of the graphical representation of the resistances so measured. The method yields phenotypic information on individual HIV infected patients on a large scale, economically and rapidly. The method is applicable to all currently available chemotherapeutic regimens and it is expected to be equally applicable to future chemotherapeutic regimens.

La présente invention concerne une méthode permettant la prise en charge du traitement chimiothérapeutique de patients infectés par le VIH qui consiste à transfecter une lignée cellulaire sensible à l'infection par le VIH avec une séquence, de préférence celle codant la transcriptase inverse et la protéase, issue du gène pol du VIH prélevé chez un patient, et un ADN recombiné du VIH dans lequel cette séquence a été supprimée, à mettre en culture les cellules transfectées de manière à créer un stock de virus chimériques, à évaluer la sensibilité phénotypique des virus chimériques à un inhibiteur de l'enzyme codée par le gène pol du VIH et à y affecter une valeur, à réaliser un ensemble de données comprenant la valeur relative à la sensibilité des virus chimériques et la valeur correspondante pour une souche chimérique de type sauvage du VIH, à répéter l'évaluation de sensibilité pour au moins deux autres inhibiteurs et ainsi réaliser au moins trois ensembles de données au total, à représenter ces ensembles de données sous forme graphique bi- ou tridimensionnelle de sorte que la différence entre les sensibilités de nature chimérique et de type sauvage dans le cas de chaque ensemble de données constitue une mesure visuelle de la résistance du stock chimérique au traitement par l'inhibiteur en question, et à sélectionner le ou les inhibiteurs optimaux sur la base de la représentation graphique des résistances ainsi mesurées. Ce procédé donne des informations phénotypiques individuelles sur des patients infectés par VIH, à grande échelle, et de manière économique et rapide. Ce procédé s'applique à toutes les posologies chimiothérapeutiques existant actuellement et est susceptible de s'appliquer également aux posologies chimiothérapeutiques futures.

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